30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4662 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4662  hypothetical protein  100 
 
 
74 aa  151  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.2161  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1158  hypothetical protein  69.86 
 
 
73 aa  108  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00402428  hitchhiker  0.0000171721 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2547  hypothetical protein  66.2 
 
 
77 aa  94.7  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1147  hypothetical protein  64.79 
 
 
79 aa  94.4  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.62198  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3239  hypothetical protein  63.16 
 
 
76 aa  92.4  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.551481  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1825  hypothetical protein  56.34 
 
 
73 aa  89  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0550  hypothetical protein  55.56 
 
 
74 aa  85.5  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0129436  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4786  hypothetical protein  60.61 
 
 
66 aa  85.9  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1259  hypothetical protein  63.51 
 
 
74 aa  85.1  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2918  hypothetical protein  54.67 
 
 
75 aa  83.6  8e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.386014 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0024  hypothetical protein  47.95 
 
 
77 aa  74.3  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4664  hypothetical protein  51.39 
 
 
74 aa  68.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.554715  normal  0.203838 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0426  hypothetical protein  44.59 
 
 
77 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5132  hypothetical protein  53.73 
 
 
66 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569085  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1132  hypothetical protein  54.1 
 
 
77 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1887  hypothetical protein  53.12 
 
 
80 aa  62.4  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127814  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2062  hypothetical protein  42.62 
 
 
69 aa  60.8  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000919693  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0609  hypothetical protein  44.12 
 
 
74 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0820  hypothetical protein  43.64 
 
 
74 aa  58.5  0.00000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1487  hypothetical protein  40.32 
 
 
69 aa  57.8  0.00000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0055  hypothetical protein  48.61 
 
 
88 aa  53.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2471  hypothetical protein  38.16 
 
 
76 aa  52.4  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0192459 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0194  hypothetical protein  43.06 
 
 
78 aa  51.2  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.989566  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1092  hypothetical protein  37.7 
 
 
76 aa  49.7  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4683  hypothetical protein  37.5 
 
 
125 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4222  hypothetical protein  45.76 
 
 
74 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2226  hypothetical protein  36.84 
 
 
74 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.972596  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0605  hypothetical protein  30.36 
 
 
72 aa  43.5  0.001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2997  hypothetical protein  25.37 
 
 
102 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5758  hypothetical protein  36.92 
 
 
74 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>