22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0055 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0055  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  174  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0194  hypothetical protein  58.67 
 
 		 78 aa  82  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.989566  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0550  hypothetical protein  48.61 
 
 		 74 aa  73.6  0.0000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0129436  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4162  hypothetical protein  45.95 
 
 		 79 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0100809  normal  0.251506 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2918  hypothetical protein  50.7 
 
 		 75 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.386014 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1887  hypothetical protein  50 
 
 		 80 aa  65.5  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127814  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4664  hypothetical protein  47.76 
 
 		 74 aa  59.7  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.554715  normal  0.203838 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1487  hypothetical protein  41.54 
 
 		 69 aa  58.9  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0426  hypothetical protein  40.26 
 
 		 77 aa  57  0.00000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4786  hypothetical protein  44.93 
 
 		 66 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2547  hypothetical protein  40.74 
 
 		 77 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4662  hypothetical protein  48.61 
 
 		 74 aa  53.5  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.2161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1147  hypothetical protein  43.75 
 
 		 79 aa  53.5  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.62198  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1158  hypothetical protein  48.61 
 
 		 73 aa  52  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00402428  hitchhiker  0.0000171721 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1825  hypothetical protein  42.67 
 
 		 73 aa  48.5  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1259  hypothetical protein  47.44 
 
 		 74 aa  45.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3239  hypothetical protein  39.74 
 
 		 76 aa  44.7  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.551481  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0024  hypothetical protein  39.19 
 
 		 77 aa  44.7  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1092  hypothetical protein  30.65 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5597  hypothetical protein  38.46 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1132  hypothetical protein  36.99 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4683  hypothetical protein  40.58 
 
 		 125 aa  40.4  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>