31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_2918 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_2918  hypothetical protein  100 
 
 
75 aa  153  6e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.386014 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4664  hypothetical protein  63.01 
 
 
74 aa  92.8  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.554715  normal  0.203838 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4662  hypothetical protein  54.67 
 
 
74 aa  83.6  8e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.2161  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0550  hypothetical protein  49.32 
 
 
74 aa  82.8  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0129436  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4786  hypothetical protein  59.7 
 
 
66 aa  82.4  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1887  hypothetical protein  52.94 
 
 
80 aa  77.4  0.00000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127814  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1487  hypothetical protein  47.69 
 
 
69 aa  72.4  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0426  hypothetical protein  43.24 
 
 
77 aa  70.5  0.000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1158  hypothetical protein  47.22 
 
 
73 aa  68.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00402428  hitchhiker  0.0000171721 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0055  hypothetical protein  50.7 
 
 
88 aa  68.6  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3239  hypothetical protein  43.42 
 
 
76 aa  66.2  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.551481  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1825  hypothetical protein  42.47 
 
 
73 aa  63.2  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1259  hypothetical protein  46.67 
 
 
74 aa  58.9  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1147  hypothetical protein  42.37 
 
 
79 aa  58.9  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.62198  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0609  hypothetical protein  37.33 
 
 
74 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2547  hypothetical protein  36.62 
 
 
77 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1092  hypothetical protein  37.7 
 
 
76 aa  53.9  0.0000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0024  hypothetical protein  36.49 
 
 
77 aa  53.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0605  hypothetical protein  35.59 
 
 
72 aa  51.2  0.000005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4284  hypothetical protein  45.76 
 
 
75 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.537368 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1132  hypothetical protein  32.43 
 
 
77 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2062  hypothetical protein  34.38 
 
 
69 aa  48.9  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000919693  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5132  hypothetical protein  38.24 
 
 
66 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569085  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4640  hypothetical protein  43.1 
 
 
75 aa  44.7  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2226  hypothetical protein  31.08 
 
 
74 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.972596  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5758  hypothetical protein  36.92 
 
 
74 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4399  hypothetical protein  40.68 
 
 
102 aa  42.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000669872  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5597  hypothetical protein  40 
 
 
77 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2471  hypothetical protein  29.33 
 
 
76 aa  41.2  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0192459 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0820  hypothetical protein  33.33 
 
 
74 aa  41.6  0.004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2066  hypothetical protein  35.09 
 
 
137 aa  41.2  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.225829  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>