26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1887 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1887  hypothetical protein  100 
 
 		 80 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127814  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4664  hypothetical protein  56.16 
 
 		 74 aa  89.7  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.554715  normal  0.203838 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2918  hypothetical protein  52.94 
 
 		 75 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.386014 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0550  hypothetical protein  47.69 
 
 		 74 aa  68.2  0.00000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0129436  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0055  hypothetical protein  50 
 
 		 88 aa  65.5  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0426  hypothetical protein  44.12 
 
 		 77 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4662  hypothetical protein  53.12 
 
 		 74 aa  62.4  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.2161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1825  hypothetical protein  48.44 
 
 		 73 aa  60.8  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4640  hypothetical protein  49.21 
 
 		 75 aa  60.5  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4284  hypothetical protein  47.62 
 
 		 75 aa  58.9  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.537368 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4162  hypothetical protein  45.21 
 
 		 79 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0100809  normal  0.251506 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4786  hypothetical protein  48.21 
 
 		 66 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1132  hypothetical protein  46.88 
 
 		 77 aa  53.9  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4683  hypothetical protein  41.27 
 
 		 125 aa  52.8  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4399  hypothetical protein  42.86 
 
 		 102 aa  51.6  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000669872  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1147  hypothetical protein  47.27 
 
 		 79 aa  50.8  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.62198  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1158  hypothetical protein  44.62 
 
 		 73 aa  50.8  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00402428  hitchhiker  0.0000171721 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1487  hypothetical protein  41.38 
 
 		 69 aa  49.3  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0609  hypothetical protein  39.13 
 
 		 74 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3239  hypothetical protein  40 
 
 		 76 aa  45.4  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.551481  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1259  hypothetical protein  47.83 
 
 		 74 aa  45.1  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0024  hypothetical protein  39.06 
 
 		 77 aa  44.3  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2547  hypothetical protein  39.06 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5758  hypothetical protein  40 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2471  hypothetical protein  37.1 
 
 		 76 aa  40.8  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192459 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2062  hypothetical protein  30.3 
 
 		 69 aa  40  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000919693  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>