28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1158 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1158  hypothetical protein  100 
 
 
73 aa  150  7e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00402428  hitchhiker  0.0000171721 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4662  hypothetical protein  69.86 
 
 
74 aa  108  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.2161  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1825  hypothetical protein  60.27 
 
 
73 aa  96.3  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0550  hypothetical protein  60.81 
 
 
74 aa  92  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0129436  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3239  hypothetical protein  62.16 
 
 
76 aa  91.7  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.551481  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1147  hypothetical protein  56.94 
 
 
79 aa  87.8  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.62198  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1259  hypothetical protein  66.67 
 
 
74 aa  82.8  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2547  hypothetical protein  57.75 
 
 
77 aa  80.9  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4786  hypothetical protein  53.03 
 
 
66 aa  74.3  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2918  hypothetical protein  47.22 
 
 
75 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.386014 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0024  hypothetical protein  41.43 
 
 
77 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0820  hypothetical protein  49.09 
 
 
74 aa  63.2  0.000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2062  hypothetical protein  39.71 
 
 
69 aa  62.8  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000919693  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1487  hypothetical protein  45.31 
 
 
69 aa  60.1  0.000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0426  hypothetical protein  38.36 
 
 
77 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4664  hypothetical protein  44.59 
 
 
74 aa  56.6  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.554715  normal  0.203838 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0055  hypothetical protein  48.61 
 
 
88 aa  52  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5758  hypothetical protein  40.62 
 
 
74 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1132  hypothetical protein  44.07 
 
 
77 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1887  hypothetical protein  44.62 
 
 
80 aa  50.8  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127814  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0609  hypothetical protein  41.18 
 
 
74 aa  50.4  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1092  hypothetical protein  33.85 
 
 
76 aa  48.9  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5597  hypothetical protein  44.62 
 
 
77 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2471  hypothetical protein  33.33 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0192459 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5132  hypothetical protein  48.48 
 
 
66 aa  45.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569085  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0194  hypothetical protein  38.89 
 
 
78 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.989566  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4162  hypothetical protein  44.26 
 
 
79 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0100809  normal  0.251506 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4683  hypothetical protein  37.5 
 
 
125 aa  44.7  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>