26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0609 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A0609  hypothetical protein  100 
 
 
74 aa  154  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5132  hypothetical protein  61.19 
 
 
66 aa  77.8  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569085  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2226  hypothetical protein  46.58 
 
 
74 aa  67  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.972596  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0550  hypothetical protein  43.75 
 
 
74 aa  61.6  0.000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0129436  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4662  hypothetical protein  44.12 
 
 
74 aa  61.2  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.2161  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1147  hypothetical protein  48.39 
 
 
79 aa  60.1  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.62198  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2547  hypothetical protein  41.79 
 
 
77 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4786  hypothetical protein  40.91 
 
 
66 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2918  hypothetical protein  37.33 
 
 
75 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.386014 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1259  hypothetical protein  44.93 
 
 
74 aa  52.4  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4664  hypothetical protein  33.33 
 
 
74 aa  51.2  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.554715  normal  0.203838 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0426  hypothetical protein  37.14 
 
 
77 aa  50.4  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0024  hypothetical protein  34.78 
 
 
77 aa  50.4  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3239  hypothetical protein  39.44 
 
 
76 aa  50.4  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.551481  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1158  hypothetical protein  41.18 
 
 
73 aa  50.4  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00402428  hitchhiker  0.0000171721 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4640  hypothetical protein  47.83 
 
 
75 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4399  hypothetical protein  50 
 
 
102 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000669872  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2062  hypothetical protein  32.81 
 
 
69 aa  49.3  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000919693  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1887  hypothetical protein  39.13 
 
 
80 aa  49.3  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127814  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1132  hypothetical protein  38.03 
 
 
77 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0820  hypothetical protein  38.89 
 
 
74 aa  45.8  0.0002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5177  hypothetical protein  44.59 
 
 
123 aa  45.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.492056  normal  0.750355 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1825  hypothetical protein  34.72 
 
 
73 aa  45.1  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4683  hypothetical protein  34.92 
 
 
125 aa  44.7  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2471  hypothetical protein  33.33 
 
 
76 aa  44.7  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0192459 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4284  hypothetical protein  41.3 
 
 
75 aa  43.9  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.537368 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>