14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5177 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5177  hypothetical protein  100 
 
 		 123 aa  256  6e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.492056  normal  0.750355 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5132  hypothetical protein  45.59 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569085  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2226  hypothetical protein  44.78 
 
 		 74 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.972596  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0609  hypothetical protein  44.59 
 
 		 74 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0550  hypothetical protein  36.23 
 
 		 74 aa  50.1  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0129436  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0426  hypothetical protein  35.14 
 
 		 77 aa  47.8  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1132  hypothetical protein  37.14 
 
 		 77 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2918  hypothetical protein  32.39 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.386014 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4662  hypothetical protein  37.88 
 
 		 74 aa  43.9  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.2161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4664  hypothetical protein  30.88 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.554715  normal  0.203838 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1825  hypothetical protein  34.78 
 
 		 73 aa  41.2  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2062  hypothetical protein  33.87 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000919693  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1887  hypothetical protein  35.21 
 
 		 80 aa  40.8  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127814  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0024  hypothetical protein  31.34 
 
 		 77 aa  40.4  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>