30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1825 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1825  hypothetical protein  100 
 
 		 73 aa  148  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1158  hypothetical protein  60.27 
 
 		 73 aa  96.3  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00402428  hitchhiker  0.0000171721 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4662  hypothetical protein  56.34 
 
 		 74 aa  89  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.2161  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0550  hypothetical protein  52.7 
 
 		 74 aa  73.9  0.0000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0129436  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3239  hypothetical protein  52.17 
 
 		 76 aa  71.6  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.551481  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0024  hypothetical protein  47.95 
 
 		 77 aa  72  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1259  hypothetical protein  60.56 
 
 		 74 aa  70.5  0.000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1147  hypothetical protein  44.44 
 
 		 79 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.62198  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2918  hypothetical protein  42.47 
 
 		 75 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.386014 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1487  hypothetical protein  43.75 
 
 		 69 aa  63.2  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0426  hypothetical protein  44.12 
 
 		 77 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2547  hypothetical protein  44.29 
 
 		 77 aa  62  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1887  hypothetical protein  48.44 
 
 		 80 aa  60.8  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127814  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4786  hypothetical protein  40.91 
 
 		 66 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4683  hypothetical protein  44.12 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1132  hypothetical protein  45 
 
 		 77 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2471  hypothetical protein  39.68 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192459 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0055  hypothetical protein  42.67 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4640  hypothetical protein  44.64 
 
 		 75 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5597  hypothetical protein  47.62 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5758  hypothetical protein  37.68 
 
 		 74 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0820  hypothetical protein  37.5 
 
 		 74 aa  46.6  0.0001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1092  hypothetical protein  31.58 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4664  hypothetical protein  35.14 
 
 		 74 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.554715  normal  0.203838 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4284  hypothetical protein  40 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.537368 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4222  hypothetical protein  37.14 
 
 		 74 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0194  hypothetical protein  42.25 
 
 		 78 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.989566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0609  hypothetical protein  34.72 
 
 		 74 aa  45.1  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2062  hypothetical protein  28.57 
 
 		 69 aa  44.3  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000919693  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5132  hypothetical protein  40.62 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569085  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>