19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2471 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2471  hypothetical protein  100 
 
 
76 aa  156  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0192459 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3239  hypothetical protein  45.21 
 
 
76 aa  65.5  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.551481  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1132  hypothetical protein  42.47 
 
 
77 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4162  hypothetical protein  43.04 
 
 
79 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0100809  normal  0.251506 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1147  hypothetical protein  43.28 
 
 
79 aa  53.9  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.62198  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0550  hypothetical protein  39.68 
 
 
74 aa  52.8  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0129436  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4662  hypothetical protein  38.16 
 
 
74 aa  52.4  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.2161  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1259  hypothetical protein  48.48 
 
 
74 aa  52.4  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1825  hypothetical protein  39.68 
 
 
73 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1158  hypothetical protein  33.33 
 
 
73 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00402428  hitchhiker  0.0000171721 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4683  hypothetical protein  38.6 
 
 
125 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2547  hypothetical protein  38.57 
 
 
77 aa  46.2  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1487  hypothetical protein  39.39 
 
 
69 aa  45.8  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0426  hypothetical protein  36.67 
 
 
77 aa  45.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0609  hypothetical protein  33.33 
 
 
74 aa  44.7  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4399  hypothetical protein  36.92 
 
 
102 aa  42.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000669872  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2918  hypothetical protein  29.33 
 
 
75 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.386014 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1887  hypothetical protein  37.1 
 
 
80 aa  40.8  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127814  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0024  hypothetical protein  29.17 
 
 
77 aa  40  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>