14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4162 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4162  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  161  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0100809  normal  0.251506 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0194  hypothetical protein  49.28 
 
 		 78 aa  70.9  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.989566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0055  hypothetical protein  45.95 
 
 		 88 aa  69.7  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1177  hypothetical protein  41.43 
 
 		 70 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.401829  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1887  hypothetical protein  45.21 
 
 		 80 aa  56.2  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127814  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2471  hypothetical protein  43.04 
 
 		 76 aa  56.2  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192459 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1487  hypothetical protein  36.62 
 
 		 69 aa  45.8  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1147  hypothetical protein  44.07 
 
 		 79 aa  45.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.62198  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1158  hypothetical protein  44.26 
 
 		 73 aa  45.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00402428  hitchhiker  0.0000171721 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4284  hypothetical protein  44.78 
 
 		 75 aa  45.4  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.537368 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4683  hypothetical protein  37.5 
 
 		 125 aa  44.7  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4640  hypothetical protein  42.42 
 
 		 75 aa  42  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3239  hypothetical protein  40.62 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.551481  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4786  hypothetical protein  39.68 
 
 		 66 aa  40.4  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>