16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0194 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_0194  hypothetical protein  100 
 
 
78 aa  158  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.989566  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0055  hypothetical protein  58.67 
 
 
88 aa  82  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4162  hypothetical protein  49.28 
 
 
79 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0100809  normal  0.251506 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1147  hypothetical protein  44.74 
 
 
79 aa  60.8  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.62198  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2547  hypothetical protein  41.33 
 
 
77 aa  52  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4662  hypothetical protein  43.06 
 
 
74 aa  51.2  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.2161  normal 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0024  hypothetical protein  36.84 
 
 
77 aa  47  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1825  hypothetical protein  42.25 
 
 
73 aa  45.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1158  hypothetical protein  38.89 
 
 
73 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00402428  hitchhiker  0.0000171721 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1132  hypothetical protein  42.42 
 
 
77 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1259  hypothetical protein  43.06 
 
 
74 aa  41.6  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1487  hypothetical protein  39.68 
 
 
69 aa  41.2  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5597  hypothetical protein  42.86 
 
 
77 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4683  hypothetical protein  41.51 
 
 
125 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3239  hypothetical protein  38.71 
 
 
76 aa  40.8  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.551481  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4786  hypothetical protein  36.36 
 
 
66 aa  40.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>