13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4222 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B4222  hypothetical protein  100 
 
 
74 aa  153  8e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4662  hypothetical protein  46.55 
 
 
74 aa  57  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.2161  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1825  hypothetical protein  37.14 
 
 
73 aa  53.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0609  hypothetical protein  38.6 
 
 
74 aa  47  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2226  hypothetical protein  42.86 
 
 
74 aa  47  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.972596  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0550  hypothetical protein  36.67 
 
 
74 aa  46.2  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0129436  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1887  hypothetical protein  44.44 
 
 
80 aa  45.1  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127814  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1147  hypothetical protein  36.67 
 
 
79 aa  44.7  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.62198  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2918  hypothetical protein  33.33 
 
 
75 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.386014 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1158  hypothetical protein  37.29 
 
 
73 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00402428  hitchhiker  0.0000171721 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5132  hypothetical protein  40.98 
 
 
66 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569085  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1259  hypothetical protein  46.55 
 
 
74 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0024  hypothetical protein  35.71 
 
 
77 aa  41.2  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>