22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4652 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4652  hypothetical protein  100 
 
 
393 aa  819    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3408  hypothetical protein  55.64 
 
 
417 aa  426  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0965913 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0480  hypothetical protein  50.77 
 
 
388 aa  386  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0958  alpha/beta hydrolase fold protein  51.87 
 
 
394 aa  380  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.227106  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1590  hypothetical protein  50 
 
 
396 aa  363  2e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.895385  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1614  hypothetical protein  50 
 
 
396 aa  363  2e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.904651 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1560  hypothetical protein  49.73 
 
 
396 aa  362  6e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.98417 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1896  hypothetical protein  50.89 
 
 
412 aa  341  2e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4464  hypothetical protein  46.98 
 
 
402 aa  338  8e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0650675 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1118  alpha/beta hydrolase fold  49.05 
 
 
380 aa  318  1e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.103042 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1015  hypothetical protein  41.13 
 
 
401 aa  306  6e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.128614 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5104  hypothetical protein  39.33 
 
 
373 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293551  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0405  hypothetical protein  33.33 
 
 
378 aa  188  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10276  hypothetical protein  33.91 
 
 
377 aa  183  6e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.116962 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0333  hypothetical protein  31.61 
 
 
378 aa  176  5e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2921  hypothetical protein  30.5 
 
 
430 aa  157  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.976416  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4898  hypothetical protein  32.72 
 
 
419 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.108405  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3776  hypothetical protein  29.64 
 
 
395 aa  140  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0619502  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4127  hypothetical protein  29.67 
 
 
442 aa  138  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.978322 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3104  hypothetical protein  29.88 
 
 
417 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5487  hypothetical protein  30.14 
 
 
428 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02394  conserved hypothetical protein  27.88 
 
 
410 aa  53.9  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.495631 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>