22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5104 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_5104  hypothetical protein  100 
 
 		 373 aa  764    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293551  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3408  hypothetical protein  39.43 
 
 		 417 aa  219  5e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965913 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1560  hypothetical protein  39.14 
 
 		 396 aa  216  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.98417 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0480  hypothetical protein  38.33 
 
 		 388 aa  215  8e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4652  hypothetical protein  39.33 
 
 		 393 aa  214  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0958  alpha/beta hydrolase fold protein  39.94 
 
 		 394 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.227106  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1590  hypothetical protein  38.77 
 
 		 396 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.895385  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1614  hypothetical protein  38.77 
 
 		 396 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.904651 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1896  hypothetical protein  39.88 
 
 		 412 aa  209  8e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4464  hypothetical protein  39.7 
 
 		 402 aa  205  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0650675 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1118  alpha/beta hydrolase fold  39.18 
 
 		 380 aa  195  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.103042 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1015  hypothetical protein  39.13 
 
 		 401 aa  192  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.128614 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5487  hypothetical protein  38.1 
 
 		 428 aa  188  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4898  hypothetical protein  35.61 
 
 		 419 aa  182  7e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.108405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0405  hypothetical protein  36.72 
 
 		 378 aa  179  8e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3104  hypothetical protein  35.91 
 
 		 417 aa  178  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3776  hypothetical protein  35.41 
 
 		 395 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0619502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0333  hypothetical protein  35.82 
 
 		 378 aa  173  5e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10276  hypothetical protein  35.05 
 
 		 377 aa  171  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.116962 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4127  hypothetical protein  33.97 
 
 		 442 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.978322 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2921  hypothetical protein  33.24 
 
 		 430 aa  154  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.976416  normal  0.592473 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02394  conserved hypothetical protein  30.86 
 
 		 410 aa  56.2  0.0000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.495631 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>