22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1896 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4464  hypothetical protein  90.53 
 
 
402 aa  764    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0650675 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1590  hypothetical protein  84.56 
 
 
396 aa  719    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.895385  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1614  hypothetical protein  84.56 
 
 
396 aa  719    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.904651 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1560  hypothetical protein  84.31 
 
 
396 aa  717    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.98417 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1896  hypothetical protein  100 
 
 
412 aa  856    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0958  alpha/beta hydrolase fold protein  71.07 
 
 
394 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.227106  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0480  hypothetical protein  53.45 
 
 
388 aa  450  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1015  hypothetical protein  50.74 
 
 
401 aa  421  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.128614 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1118  alpha/beta hydrolase fold  54.02 
 
 
380 aa  407  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.103042 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4652  hypothetical protein  50.89 
 
 
393 aa  341  2e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3408  hypothetical protein  44.42 
 
 
417 aa  333  4e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0965913 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0405  hypothetical protein  39.13 
 
 
378 aa  209  5e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5104  hypothetical protein  39.88 
 
 
373 aa  209  9e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293551  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10276  hypothetical protein  40.07 
 
 
377 aa  207  4e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.116962 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0333  hypothetical protein  38.51 
 
 
378 aa  205  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4898  hypothetical protein  31.11 
 
 
419 aa  167  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.108405  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3104  hypothetical protein  31.94 
 
 
417 aa  152  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4127  hypothetical protein  30.15 
 
 
442 aa  149  6e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.978322 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5487  hypothetical protein  30.25 
 
 
428 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2921  hypothetical protein  29.88 
 
 
430 aa  137  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.976416  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3776  hypothetical protein  27.22 
 
 
395 aa  125  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0619502  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1766  hypothetical protein  37.04 
 
 
140 aa  51.2  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.666227  normal  0.377294 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>