23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4127 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_4127  hypothetical protein  100 
 
 
442 aa  899    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.978322 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5487  hypothetical protein  64.68 
 
 
428 aa  561  1.0000000000000001e-159  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4898  hypothetical protein  58.55 
 
 
419 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.108405  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3104  hypothetical protein  55.34 
 
 
417 aa  456  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3776  hypothetical protein  55.95 
 
 
395 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0619502  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2921  hypothetical protein  40.2 
 
 
430 aa  247  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.976416  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0958  alpha/beta hydrolase fold protein  33.77 
 
 
394 aa  172  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.227106  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5104  hypothetical protein  33.6 
 
 
373 aa  165  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293551  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1560  hypothetical protein  31.12 
 
 
396 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.98417 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1614  hypothetical protein  30.85 
 
 
396 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.904651 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1590  hypothetical protein  30.85 
 
 
396 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.895385  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1896  hypothetical protein  30.15 
 
 
412 aa  149  7e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0480  hypothetical protein  30.38 
 
 
388 aa  142  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4464  hypothetical protein  30.59 
 
 
402 aa  139  8.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0650675 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4652  hypothetical protein  29.67 
 
 
393 aa  138  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10276  hypothetical protein  31.04 
 
 
377 aa  137  4e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.116962 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0405  hypothetical protein  32.69 
 
 
378 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0333  hypothetical protein  31.59 
 
 
378 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1118  alpha/beta hydrolase fold  32.2 
 
 
380 aa  128  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.103042 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3408  hypothetical protein  29.56 
 
 
417 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0965913 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1015  hypothetical protein  27.99 
 
 
401 aa  117  5e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.128614 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02394  conserved hypothetical protein  27.8 
 
 
410 aa  56.2  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.495631 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1424  hypothetical protein  32.5 
 
 
273 aa  43.5  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0470419  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>