22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5487 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5487  hypothetical protein  100 
 
 
428 aa  878    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4127  hypothetical protein  64.68 
 
 
442 aa  559  1e-158  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.978322 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4898  hypothetical protein  59.45 
 
 
419 aa  487  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.108405  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3776  hypothetical protein  58.27 
 
 
395 aa  444  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0619502  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3104  hypothetical protein  53.81 
 
 
417 aa  436  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2921  hypothetical protein  36.66 
 
 
430 aa  238  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.976416  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5104  hypothetical protein  38.1 
 
 
373 aa  188  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293551  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0958  alpha/beta hydrolase fold protein  33.93 
 
 
394 aa  169  6e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.227106  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1614  hypothetical protein  31.22 
 
 
396 aa  149  6e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.904651 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1590  hypothetical protein  31.22 
 
 
396 aa  149  6e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.895385  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1896  hypothetical protein  30.25 
 
 
412 aa  147  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1560  hypothetical protein  31.27 
 
 
396 aa  146  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.98417 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4464  hypothetical protein  30.03 
 
 
402 aa  144  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0650675 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0480  hypothetical protein  32.65 
 
 
388 aa  141  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1015  hypothetical protein  30.93 
 
 
401 aa  138  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.128614 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3408  hypothetical protein  31.79 
 
 
417 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0965913 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0405  hypothetical protein  32.27 
 
 
378 aa  134  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4652  hypothetical protein  30.14 
 
 
393 aa  134  5e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0333  hypothetical protein  30.65 
 
 
378 aa  132  9e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1118  alpha/beta hydrolase fold  31.98 
 
 
380 aa  130  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.103042 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10276  hypothetical protein  30.95 
 
 
377 aa  126  9e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.116962 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02394  conserved hypothetical protein  27.15 
 
 
410 aa  47.8  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.495631 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>