23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10276 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10276  hypothetical protein  100 
 
 
377 aa  776    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.116962 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0405  hypothetical protein  80.69 
 
 
378 aa  642    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0333  hypothetical protein  81.07 
 
 
378 aa  643    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1896  hypothetical protein  40.07 
 
 
412 aa  216  5e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1560  hypothetical protein  39.62 
 
 
396 aa  216  5e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.98417 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1590  hypothetical protein  38.99 
 
 
396 aa  212  9e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.895385  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1614  hypothetical protein  38.99 
 
 
396 aa  212  9e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.904651 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1015  hypothetical protein  37.5 
 
 
401 aa  209  8e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.128614 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0958  alpha/beta hydrolase fold protein  38.31 
 
 
394 aa  207  3e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.227106  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4464  hypothetical protein  38.44 
 
 
402 aa  203  4e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0650675 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0480  hypothetical protein  35.23 
 
 
388 aa  196  5.000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4652  hypothetical protein  33.91 
 
 
393 aa  195  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5104  hypothetical protein  35.05 
 
 
373 aa  178  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293551  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3408  hypothetical protein  35.51 
 
 
417 aa  177  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0965913 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1118  alpha/beta hydrolase fold  34.15 
 
 
380 aa  176  4e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.103042 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2921  hypothetical protein  31.66 
 
 
430 aa  156  6e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.976416  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3776  hypothetical protein  29.3 
 
 
395 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0619502  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4898  hypothetical protein  29.15 
 
 
419 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.108405  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4127  hypothetical protein  30.77 
 
 
442 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.978322 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5487  hypothetical protein  30.95 
 
 
428 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3104  hypothetical protein  31.19 
 
 
417 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1766  hypothetical protein  44.21 
 
 
140 aa  78.6  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.666227  normal  0.377294 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02394  conserved hypothetical protein  23.81 
 
 
410 aa  52  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.495631 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>