23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1015 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1015  hypothetical protein  100 
 
 		 401 aa  823    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.128614 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1590  hypothetical protein  53.65 
 
 		 396 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.895385  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1614  hypothetical protein  53.65 
 
 		 396 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.904651 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1560  hypothetical protein  52.86 
 
 		 396 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.98417 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1896  hypothetical protein  50.74 
 
 		 412 aa  421  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4464  hypothetical protein  50.76 
 
 		 402 aa  419  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0650675 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0958  alpha/beta hydrolase fold protein  51.3 
 
 		 394 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.227106  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0480  hypothetical protein  46.84 
 
 		 388 aa  353  4e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3408  hypothetical protein  42.93 
 
 		 417 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965913 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4652  hypothetical protein  41.13 
 
 		 393 aa  306  6e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1118  alpha/beta hydrolase fold  43.95 
 
 		 380 aa  304  2.0000000000000002e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.103042 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10276  hypothetical protein  36.88 
 
 		 377 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.116962 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0405  hypothetical protein  38.01 
 
 		 378 aa  192  7e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5104  hypothetical protein  39.13 
 
 		 373 aa  192  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293551  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0333  hypothetical protein  36.76 
 
 		 378 aa  188  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2921  hypothetical protein  29.59 
 
 		 430 aa  145  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.976416  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4898  hypothetical protein  29.43 
 
 		 419 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.108405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5487  hypothetical protein  30.93 
 
 		 428 aa  138  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4127  hypothetical protein  27.99 
 
 		 442 aa  117  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.978322 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3104  hypothetical protein  26.42 
 
 		 417 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3776  hypothetical protein  30.09 
 
 		 395 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0619502  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02394  conserved hypothetical protein  25.18 
 
 		 410 aa  49.7  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.495631 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1766  hypothetical protein  38.1 
 
 		 140 aa  49.7  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.666227  normal  0.377294 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>