23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4898 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4898  hypothetical protein  100 
 
 
419 aa  857    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.108405  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4127  hypothetical protein  58.55 
 
 
442 aa  489  1e-137  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.978322 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5487  hypothetical protein  59.45 
 
 
428 aa  487  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3104  hypothetical protein  56.17 
 
 
417 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3776  hypothetical protein  55.91 
 
 
395 aa  439  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0619502  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2921  hypothetical protein  39.95 
 
 
430 aa  245  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.976416  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5104  hypothetical protein  35.61 
 
 
373 aa  182  8.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293551  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0958  alpha/beta hydrolase fold protein  34.59 
 
 
394 aa  173  5e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.227106  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1896  hypothetical protein  31.11 
 
 
412 aa  167  4e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1614  hypothetical protein  31.35 
 
 
396 aa  163  6e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.904651 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1590  hypothetical protein  31.35 
 
 
396 aa  163  6e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.895385  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1560  hypothetical protein  32.46 
 
 
396 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.98417 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0480  hypothetical protein  32.8 
 
 
388 aa  158  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4464  hypothetical protein  30.79 
 
 
402 aa  158  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0650675 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4652  hypothetical protein  32.72 
 
 
393 aa  155  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3408  hypothetical protein  31.66 
 
 
417 aa  150  6e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0965913 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1015  hypothetical protein  29.43 
 
 
401 aa  145  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.128614 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0333  hypothetical protein  30.16 
 
 
378 aa  143  6e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0405  hypothetical protein  31.22 
 
 
378 aa  142  8e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1118  alpha/beta hydrolase fold  32.15 
 
 
380 aa  139  7.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.103042 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10276  hypothetical protein  28.91 
 
 
377 aa  138  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.116962 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02394  conserved hypothetical protein  26.62 
 
 
410 aa  49.3  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.495631 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0467  hypothetical protein  28.67 
 
 
323 aa  43.1  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0878073  normal  0.183079 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>