More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2458 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2458  glycine dehydrogenase subunit 2  100 
 
 		 531 aa  1100    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2731  glycine dehydrogenase subunit 2  66.79 
 
 		 532 aa  736    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0541942  normal  0.0898713 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2033  glycine dehydrogenase subunit 2  63.65 
 
 		 523 aa  706    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00105152  normal  0.440854 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7698  glycine dehydrogenase subunit 2  62.92 
 
 		 519 aa  681    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.539443 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0210  glycine dehydrogenase subunit 2  40 
 
 		 500 aa  359  7e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.37883  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23410  glycine dehydrogenase subunit 2  41.05 
 
 		 479 aa  352  8.999999999999999e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0423957  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1798  glycine dehydrogenase subunit 2  43.25 
 
 		 487 aa  352  1e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0216  glycine dehydrogenase subunit 2  41.42 
 
 		 490 aa  342  1e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0974  glycine dehydrogenase subunit 2  38.1 
 
 		 477 aa  342  1e-92  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0173  glycine dehydrogenase subunit 2  41.6 
 
 		 483 aa  338  9.999999999999999e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.267344 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2359  glycine dehydrogenase subunit 2  40.76 
 
 		 485 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000690583  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1887  glycine dehydrogenase subunit 2  38.4 
 
 		 481 aa  335  1e-90  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1658  glycine dehydrogenase subunit 2  38.74 
 
 		 481 aa  333  6e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0700  Glycine dehydrogenase (decarboxylating)  38.14 
 
 		 481 aa  331  2e-89  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0229  glycine dehydrogenase subunit 2  38.82 
 
 		 484 aa  330  3e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0249  glycine dehydrogenase subunit 2  41.16 
 
 		 491 aa  330  5.0000000000000004e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.494038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1942  glycine dehydrogenase subunit 2  39.43 
 
 		 485 aa  329  6e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000124327  hitchhiker  0.000000296653 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2871  glycine dehydrogenase subunit 2  41.34 
 
 		 489 aa  329  7e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0734  glycine dehydrogenase subunit 2  38.43 
 
 		 474 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0710  glycine dehydrogenase subunit 2  38.43 
 
 		 474 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1716  Glycine dehydrogenase (decarboxylating)  39.37 
 
 		 503 aa  326  6e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.658933 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2755  glycine dehydrogenase subunit 2  39.22 
 
 		 496 aa  325  2e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1980  glycine dehydrogenase subunit 2  40.53 
 
 		 486 aa  322  7e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0723  glycine dehydrogenase subunit 2  38.95 
 
 		 484 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0355451  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1665  glycine dehydrogenase subunit 2  36.27 
 
 		 496 aa  320  5e-86  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00835735  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0348  glycine dehydrogenase subunit 2  39.58 
 
 		 488 aa  319  7e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1593  glycine dehydrogenase subunit 2  38.48 
 
 		 490 aa  319  1e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.243089  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1626  glycine dehydrogenase subunit 2  38.48 
 
 		 490 aa  319  1e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2748  glycine dehydrogenase subunit 2  37.26 
 
 		 488 aa  318  1e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1194  glycine dehydrogenase subunit 2  39.34 
 
 		 488 aa  318  2e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1898  Glycine dehydrogenase (decarboxylating)  35.04 
 
 		 508 aa  317  4e-85  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0113  glycine dehydrogenase subunit 2  38.19 
 
 		 484 aa  315  9.999999999999999e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0128  glycine dehydrogenase subunit 2  38.19 
 
 		 484 aa  314  1.9999999999999998e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0163  glycine dehydrogenase subunit 2  38.62 
 
 		 486 aa  312  6.999999999999999e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.546611  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1100  glycine dehydrogenase subunit 2  38.05 
 
 		 502 aa  311  1e-83  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0127  glycine dehydrogenase subunit 2  37.19 
 
 		 508 aa  312  1e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2580  glycine dehydrogenase subunit 2  38.34 
 
 		 511 aa  311  1e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025975  normal  0.0266723 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0179  glycine dehydrogenase subunit 2  39.54 
 
 		 482 aa  310  4e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.505753  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2596  Glycine dehydrogenase (decarboxylating)  36.79 
 
 		 491 aa  310  5e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0171  glycine dehydrogenase subunit 2  38.38 
 
 		 487 aa  309  9e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.939374 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2547  glycine dehydrogenase subunit 2  37.14 
 
 		 486 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1914  glycine dehydrogenase subunit 2  35.28 
 
 		 478 aa  306  4.0000000000000004e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.453538  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2913  glycine dehydrogenase subunit 2  38.08 
 
 		 491 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000385002  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1900  glycine dehydrogenase subunit 2  36.81 
 
 		 491 aa  305  1.0000000000000001e-81  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0293  glycine dehydrogenase subunit 2  36.81 
 
 		 491 aa  305  1.0000000000000001e-81  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1357  Glycine dehydrogenase (decarboxylating)  38.57 
 
 		 483 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4036  glycine dehydrogenase subunit 2  37.37 
 
 		 487 aa  303  7.000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4303  glycine dehydrogenase subunit 2  37.68 
 
 		 491 aa  302  1e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000146938  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0903  glycine dehydrogenase subunit 2  37.47 
 
 		 491 aa  302  1e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000134487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2281  glycine dehydrogenase subunit 2  38.6 
 
 		 518 aa  301  1e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.900236  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4337  glycine dehydrogenase subunit 2  37.47 
 
 		 491 aa  301  2e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00444907  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1561  glycine dehydrogenase subunit 2  37.45 
 
 		 491 aa  301  2e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2496  glycine dehydrogenase subunit 2  38.28 
 
 		 486 aa  301  2e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4129  glycine dehydrogenase subunit 2  37.47 
 
 		 491 aa  300  4e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.289534  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3969  glycine dehydrogenase subunit 2  37.47 
 
 		 491 aa  300  4e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000695556  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3979  glycine dehydrogenase subunit 2  37.47 
 
 		 491 aa  300  4e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00103268  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4245  glycine dehydrogenase subunit 2  37.47 
 
 		 491 aa  300  4e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4356  glycine dehydrogenase subunit 2  37.47 
 
 		 491 aa  300  4e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000339939  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4447  glycine dehydrogenase subunit 2  37.47 
 
 		 491 aa  300  4e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00139398  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4080  glycine dehydrogenase subunit 2  37.26 
 
 		 491 aa  299  1e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000357312  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1518  glycine dehydrogenase subunit 2  35.45 
 
 		 480 aa  298  1e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2717  glycine dehydrogenase subunit 2  38.62 
 
 		 522 aa  298  2e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1242  glycine dehydrogenase subunit 2  38.83 
 
 		 492 aa  297  3e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2002  Glycine dehydrogenase (decarboxylating)  37.95 
 
 		 484 aa  297  4e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1522  glycine dehydrogenase subunit 2  38.4 
 
 		 517 aa  297  4e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.689584  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2623  glycine dehydrogenase subunit 2  38.83 
 
 		 522 aa  296  6e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1624  glycine dehydrogenase subunit 2  36.61 
 
 		 482 aa  293  4e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0691  glycine dehydrogenase subunit 2  37.6 
 
 		 526 aa  293  4e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1096  glycine dehydrogenase subunit 2  39.01 
 
 		 483 aa  289  1e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.962704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0982  glycine dehydrogenase subunit 2  39.01 
 
 		 508 aa  288  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1541  glycine dehydrogenase subunit 2  35.31 
 
 		 486 aa  287  2.9999999999999996e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.136529  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2458  glycine dehydrogenase subunit 2  35.4 
 
 		 505 aa  286  5.999999999999999e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4144  Glycine dehydrogenase (decarboxylating)  39.1 
 
 		 474 aa  285  2.0000000000000002e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1896  glycine dehydrogenase subunit 2  38.4 
 
 		 471 aa  285  2.0000000000000002e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.273631 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1351  glycine dehydrogenase subunit 2  34.39 
 
 		 482 aa  280  4e-74  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.3112 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0223  glycine dehydrogenase subunit 2  37.87 
 
 		 481 aa  278  2e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0566189 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0336  glycine dehydrogenase subunit 2  38.41 
 
 		 481 aa  278  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1853  glycine dehydrogenase subunit 2  35.95 
 
 		 519 aa  277  4e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0670601  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0736  glycine dehydrogenase subunit 2  36.25 
 
 		 518 aa  277  4e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.101381 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0398  glycine dehydrogenase subunit 2  37.11 
 
 		 479 aa  276  6e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1579  glycine dehydrogenase subunit 2  36.95 
 
 		 488 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3048  glycine dehydrogenase subunit 2  36.48 
 
 		 504 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.932595  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2525  glycine dehydrogenase subunit 2  36.51 
 
 		 522 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.184329 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2671  glycine dehydrogenase subunit 2  36.38 
 
 		 481 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3152  glycine dehydrogenase subunit 2  37.87 
 
 		 481 aa  273  7e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3185  glycine dehydrogenase subunit 2  40.66 
 
 		 471 aa  273  8.000000000000001e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00205794  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3753  Glycine dehydrogenase (decarboxylating)  36.44 
 
 		 512 aa  270  2.9999999999999997e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0902964 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1691  glycine dehydrogenase subunit 2  36.53 
 
 		 481 aa  271  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0190164  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0396  aminotransferase class V  36.81 
 
 		 499 aa  270  5e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2197  glycine dehydrogenase subunit 2  36.61 
 
 		 523 aa  270  5.9999999999999995e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.268884  normal  0.291086 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2697  glycine dehydrogenase subunit 2  34.87 
 
 		 524 aa  269  8.999999999999999e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1867  glycine dehydrogenase subunit 2  36.23 
 
 		 517 aa  269  8.999999999999999e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.359855  normal  0.134496 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1593  glycine dehydrogenase subunit 2  36.38 
 
 		 478 aa  268  1e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.574541  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1652  glycine dehydrogenase subunit 2  36.98 
 
 		 481 aa  268  2e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00329218  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0392  glycine dehydrogenase subunit 2  37.24 
 
 		 479 aa  266  5e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.607987 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2314  Glycine dehydrogenase (decarboxylating)  36.7 
 
 		 507 aa  265  2e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4383  glycine dehydrogenase subunit 2  35.76 
 
 		 527 aa  264  4e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.798393 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1118  glycine dehydrogenase subunit 2  37.47 
 
 		 507 aa  259  8e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0378  glycine dehydrogenase subunit 2  37.08 
 
 		 481 aa  258  2e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2208  glycine dehydrogenase subunit 2  35.22 
 
 		 526 aa  258  3e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.283964  normal  0.12448 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>