More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_1626 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A4356  glycine dehydrogenase subunit 2  68.6 
 
 
491 aa  668    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000339939  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1100  glycine dehydrogenase subunit 2  88.16 
 
 
502 aa  866    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4303  glycine dehydrogenase subunit 2  68.8 
 
 
491 aa  671    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000146938  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4337  glycine dehydrogenase subunit 2  68.53 
 
 
491 aa  666    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00444907  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4129  glycine dehydrogenase subunit 2  68.53 
 
 
491 aa  666    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.289534  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3969  glycine dehydrogenase subunit 2  68.53 
 
 
491 aa  666    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000695556  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3979  glycine dehydrogenase subunit 2  68.53 
 
 
491 aa  666    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00103268  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0903  glycine dehydrogenase subunit 2  68.32 
 
 
491 aa  665    Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000134487  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0216  glycine dehydrogenase subunit 2  69.57 
 
 
490 aa  665    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2913  glycine dehydrogenase subunit 2  68.6 
 
 
491 aa  672    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000385002  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4447  glycine dehydrogenase subunit 2  68.53 
 
 
491 aa  666    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00139398  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4245  glycine dehydrogenase subunit 2  68.53 
 
 
491 aa  666    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1626  glycine dehydrogenase subunit 2  100 
 
 
490 aa  1009    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4080  glycine dehydrogenase subunit 2  68.52 
 
 
491 aa  671    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000357312  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1593  glycine dehydrogenase subunit 2  100 
 
 
490 aa  1009    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.243089  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2359  glycine dehydrogenase subunit 2  69.65 
 
 
485 aa  669    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000690583  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1798  glycine dehydrogenase subunit 2  62.82 
 
 
487 aa  606  9.999999999999999e-173  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1914  glycine dehydrogenase subunit 2  59.83 
 
 
478 aa  591  1e-168  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.453538  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0229  glycine dehydrogenase subunit 2  61.09 
 
 
484 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4036  glycine dehydrogenase subunit 2  60.46 
 
 
487 aa  580  1e-164  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23410  glycine dehydrogenase subunit 2  60.59 
 
 
479 aa  572  1.0000000000000001e-162  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0423957  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1942  glycine dehydrogenase subunit 2  58.92 
 
 
485 aa  563  1.0000000000000001e-159  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000124327  hitchhiker  0.000000296653 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2748  glycine dehydrogenase subunit 2  58.18 
 
 
488 aa  560  1e-158  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0974  glycine dehydrogenase subunit 2  56.49 
 
 
477 aa  556  1e-157  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0710  glycine dehydrogenase subunit 2  58.82 
 
 
474 aa  550  1e-155  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1357  Glycine dehydrogenase (decarboxylating)  56.31 
 
 
483 aa  547  1e-154  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0734  glycine dehydrogenase subunit 2  58.61 
 
 
474 aa  546  1e-154  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1658  glycine dehydrogenase subunit 2  56.45 
 
 
481 aa  531  1e-150  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1887  glycine dehydrogenase subunit 2  56.22 
 
 
481 aa  533  1e-150  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1980  glycine dehydrogenase subunit 2  56.08 
 
 
486 aa  531  1e-150  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0723  glycine dehydrogenase subunit 2  58.11 
 
 
484 aa  530  1e-149  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0355451  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2871  glycine dehydrogenase subunit 2  53.75 
 
 
489 aa  515  1.0000000000000001e-145  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0127  glycine dehydrogenase subunit 2  56.51 
 
 
508 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1518  glycine dehydrogenase subunit 2  56.75 
 
 
480 aa  515  1.0000000000000001e-145  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1624  glycine dehydrogenase subunit 2  55.21 
 
 
482 aa  513  1e-144  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1541  glycine dehydrogenase subunit 2  55.95 
 
 
486 aa  508  1e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.136529  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0249  glycine dehydrogenase subunit 2  54.24 
 
 
491 aa  509  1e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.494038  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0179  glycine dehydrogenase subunit 2  55.72 
 
 
482 aa  507  9.999999999999999e-143  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.505753  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0163  glycine dehydrogenase subunit 2  56.09 
 
 
486 aa  505  9.999999999999999e-143  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.546611  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0700  Glycine dehydrogenase (decarboxylating)  55.32 
 
 
481 aa  503  1e-141  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0348  glycine dehydrogenase subunit 2  54.43 
 
 
488 aa  499  1e-140  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0210  glycine dehydrogenase subunit 2  52.2 
 
 
500 aa  498  1e-140  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.37883  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2496  glycine dehydrogenase subunit 2  55.46 
 
 
486 aa  495  1e-139  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2281  glycine dehydrogenase subunit 2  50.89 
 
 
518 aa  494  9.999999999999999e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.900236  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0398  glycine dehydrogenase subunit 2  54.74 
 
 
479 aa  489  1e-137  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0171  glycine dehydrogenase subunit 2  54.83 
 
 
487 aa  488  1e-137  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.939374 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2596  Glycine dehydrogenase (decarboxylating)  48.97 
 
 
491 aa  487  1e-136  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1522  glycine dehydrogenase subunit 2  50.6 
 
 
517 aa  483  1e-135  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.689584  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2458  glycine dehydrogenase subunit 2  50.62 
 
 
505 aa  482  1e-135  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2717  glycine dehydrogenase subunit 2  50.52 
 
 
522 aa  480  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1242  glycine dehydrogenase subunit 2  50.52 
 
 
492 aa  478  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3753  Glycine dehydrogenase (decarboxylating)  52.6 
 
 
512 aa  479  1e-134  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0902964 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0392  glycine dehydrogenase subunit 2  54.32 
 
 
479 aa  479  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.607987 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2002  Glycine dehydrogenase (decarboxylating)  54.17 
 
 
484 aa  478  1e-134  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2623  glycine dehydrogenase subunit 2  50.1 
 
 
522 aa  478  1e-133  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1351  glycine dehydrogenase subunit 2  51.13 
 
 
482 aa  475  1e-133  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.3112 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0336  glycine dehydrogenase subunit 2  52.7 
 
 
481 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1579  glycine dehydrogenase subunit 2  52.84 
 
 
488 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2547  glycine dehydrogenase subunit 2  50.72 
 
 
486 aa  468  1.0000000000000001e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2755  glycine dehydrogenase subunit 2  50.94 
 
 
496 aa  467  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0293  glycine dehydrogenase subunit 2  48.57 
 
 
491 aa  464  1e-129  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1900  glycine dehydrogenase subunit 2  48.57 
 
 
491 aa  464  1e-129  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0113  glycine dehydrogenase subunit 2  51.99 
 
 
484 aa  462  1e-129  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1593  glycine dehydrogenase subunit 2  51.99 
 
 
478 aa  465  1e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.574541  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0128  glycine dehydrogenase subunit 2  51.99 
 
 
484 aa  459  9.999999999999999e-129  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0223  glycine dehydrogenase subunit 2  53.14 
 
 
481 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0566189 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1716  Glycine dehydrogenase (decarboxylating)  50.31 
 
 
503 aa  461  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.658933 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3152  glycine dehydrogenase subunit 2  52.2 
 
 
481 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0173  glycine dehydrogenase subunit 2  50.1 
 
 
483 aa  456  1e-127  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.267344 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2671  glycine dehydrogenase subunit 2  51.36 
 
 
481 aa  458  1e-127  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1105  glycine dehydrogenase subunit 2  52.63 
 
 
483 aa  455  1e-127  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1561  glycine dehydrogenase subunit 2  48.76 
 
 
491 aa  456  1e-127  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1652  glycine dehydrogenase subunit 2  52.4 
 
 
481 aa  457  1e-127  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00329218  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0378  glycine dehydrogenase subunit 2  51.99 
 
 
481 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1691  glycine dehydrogenase subunit 2  50.83 
 
 
481 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0190164  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2525  glycine dehydrogenase subunit 2  50.52 
 
 
522 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.184329 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3185  glycine dehydrogenase subunit 2  50.21 
 
 
471 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00205794  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1194  glycine dehydrogenase subunit 2  49.8 
 
 
488 aa  453  1.0000000000000001e-126  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2580  glycine dehydrogenase subunit 2  48.03 
 
 
511 aa  450  1e-125  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025975  normal  0.0266723 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1118  glycine dehydrogenase subunit 2  50.84 
 
 
507 aa  444  1e-123  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1898  Glycine dehydrogenase (decarboxylating)  50.31 
 
 
508 aa  429  1e-119  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0396  aminotransferase class V  48.1 
 
 
499 aa  427  1e-118  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0982  glycine dehydrogenase subunit 2  49.55 
 
 
508 aa  422  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1096  glycine dehydrogenase subunit 2  49.55 
 
 
483 aa  423  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.962704  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0691  glycine dehydrogenase subunit 2  46.71 
 
 
526 aa  421  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2314  Glycine dehydrogenase (decarboxylating)  50.22 
 
 
507 aa  417  9.999999999999999e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4144  Glycine dehydrogenase (decarboxylating)  50 
 
 
474 aa  418  9.999999999999999e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1896  glycine dehydrogenase subunit 2  48.95 
 
 
471 aa  415  9.999999999999999e-116  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.273631 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1665  glycine dehydrogenase subunit 2  48.73 
 
 
496 aa  416  9.999999999999999e-116  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00835735  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3048  glycine dehydrogenase subunit 2  46.8 
 
 
504 aa  414  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.932595  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2208  glycine dehydrogenase subunit 2  46.5 
 
 
526 aa  414  1e-114  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.283964  normal  0.12448 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4383  glycine dehydrogenase subunit 2  46.38 
 
 
527 aa  409  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.798393 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0736  glycine dehydrogenase subunit 2  45.64 
 
 
518 aa  407  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.101381 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0789  glycine dehydrogenase subunit 2  48.55 
 
 
482 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1867  glycine dehydrogenase subunit 2  48.68 
 
 
517 aa  400  9.999999999999999e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.359855  normal  0.134496 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2697  glycine dehydrogenase subunit 2  46.22 
 
 
524 aa  398  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2197  glycine dehydrogenase subunit 2  45.33 
 
 
523 aa  389  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.268884  normal  0.291086 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1214  glycine dehydrogenase subunit 2  48.24 
 
 
514 aa  387  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467458 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1853  glycine dehydrogenase subunit 2  44.88 
 
 
519 aa  388  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0670601  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1610  glycine dehydrogenase subunit 2  46.9 
 
 
476 aa  377  1e-103  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.731117  normal  0.416595 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>