More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_3185 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_3185  glycine dehydrogenase subunit 2  100 
 
 		 471 aa  961    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00205794  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23410  glycine dehydrogenase subunit 2  52.39 
 
 		 479 aa  488  1e-137  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0423957  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1942  glycine dehydrogenase subunit 2  54.7 
 
 		 485 aa  487  1e-136  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000124327  hitchhiker  0.000000296653 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0249  glycine dehydrogenase subunit 2  55.97 
 
 		 491 aa  486  1e-136  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.494038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0229  glycine dehydrogenase subunit 2  50.1 
 
 		 484 aa  483  1e-135  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0974  glycine dehydrogenase subunit 2  51.17 
 
 		 477 aa  482  1e-135  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2359  glycine dehydrogenase subunit 2  54.09 
 
 		 485 aa  484  1e-135  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000690583  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1357  Glycine dehydrogenase (decarboxylating)  54.01 
 
 		 483 aa  483  1e-135  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0216  glycine dehydrogenase subunit 2  54.09 
 
 		 490 aa  482  1e-135  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1798  glycine dehydrogenase subunit 2  55.67 
 
 		 487 aa  478  1e-134  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0723  glycine dehydrogenase subunit 2  52.49 
 
 		 484 aa  475  1e-133  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0355451  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0734  glycine dehydrogenase subunit 2  50.53 
 
 		 474 aa  478  1e-133  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1914  glycine dehydrogenase subunit 2  49.48 
 
 		 478 aa  477  1e-133  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.453538  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0710  glycine dehydrogenase subunit 2  50.53 
 
 		 474 aa  476  1e-133  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2913  glycine dehydrogenase subunit 2  53.25 
 
 		 491 aa  475  1e-133  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000385002  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4356  glycine dehydrogenase subunit 2  52.2 
 
 		 491 aa  472  1e-132  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000339939  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4303  glycine dehydrogenase subunit 2  52.41 
 
 		 491 aa  474  1e-132  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000146938  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4129  glycine dehydrogenase subunit 2  52.2 
 
 		 491 aa  472  1e-132  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.289534  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3969  glycine dehydrogenase subunit 2  52.2 
 
 		 491 aa  472  1e-132  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000695556  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3979  glycine dehydrogenase subunit 2  52.2 
 
 		 491 aa  472  1e-132  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00103268  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4337  glycine dehydrogenase subunit 2  52.2 
 
 		 491 aa  472  1e-132  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00444907  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4447  glycine dehydrogenase subunit 2  52.2 
 
 		 491 aa  472  1e-132  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00139398  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4245  glycine dehydrogenase subunit 2  52.2 
 
 		 491 aa  472  1e-132  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2871  glycine dehydrogenase subunit 2  55.01 
 
 		 489 aa  468  1.0000000000000001e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0903  glycine dehydrogenase subunit 2  52.2 
 
 		 491 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000134487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4080  glycine dehydrogenase subunit 2  52.2 
 
 		 491 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000357312  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2281  glycine dehydrogenase subunit 2  54.77 
 
 		 518 aa  468  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.900236  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1626  glycine dehydrogenase subunit 2  50.21 
 
 		 490 aa  467  9.999999999999999e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1658  glycine dehydrogenase subunit 2  51.37 
 
 		 481 aa  465  9.999999999999999e-131  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4036  glycine dehydrogenase subunit 2  52.72 
 
 		 487 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1593  glycine dehydrogenase subunit 2  50.21 
 
 		 490 aa  467  9.999999999999999e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.243089  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1522  glycine dehydrogenase subunit 2  54.45 
 
 		 517 aa  463  1e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.689584  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2596  Glycine dehydrogenase (decarboxylating)  49.27 
 
 		 491 aa  464  1e-129  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2002  Glycine dehydrogenase (decarboxylating)  55.39 
 
 		 484 aa  464  1e-129  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1100  glycine dehydrogenase subunit 2  48.94 
 
 		 502 aa  460  9.999999999999999e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0210  glycine dehydrogenase subunit 2  48.65 
 
 		 500 aa  448  1e-125  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.37883  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1518  glycine dehydrogenase subunit 2  49.37 
 
 		 480 aa  449  1e-125  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0127  glycine dehydrogenase subunit 2  50 
 
 		 508 aa  445  1.0000000000000001e-124  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0163  glycine dehydrogenase subunit 2  51.14 
 
 		 486 aa  445  1.0000000000000001e-124  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.546611  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2623  glycine dehydrogenase subunit 2  53.54 
 
 		 522 aa  444  1e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1242  glycine dehydrogenase subunit 2  53.03 
 
 		 492 aa  444  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1980  glycine dehydrogenase subunit 2  49.69 
 
 		 486 aa  444  1e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1351  glycine dehydrogenase subunit 2  48.84 
 
 		 482 aa  439  9.999999999999999e-123  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.3112 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2717  glycine dehydrogenase subunit 2  53.12 
 
 		 522 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1541  glycine dehydrogenase subunit 2  48.32 
 
 		 486 aa  437  1e-121  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.136529  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2525  glycine dehydrogenase subunit 2  51.56 
 
 		 522 aa  435  1e-121  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.184329 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1887  glycine dehydrogenase subunit 2  47.66 
 
 		 481 aa  437  1e-121  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2748  glycine dehydrogenase subunit 2  46.56 
 
 		 488 aa  432  1e-120  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0171  glycine dehydrogenase subunit 2  49.9 
 
 		 487 aa  432  1e-120  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.939374 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0398  glycine dehydrogenase subunit 2  51.15 
 
 		 479 aa  434  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1900  glycine dehydrogenase subunit 2  49.27 
 
 		 491 aa  429  1e-119  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0179  glycine dehydrogenase subunit 2  49.26 
 
 		 482 aa  430  1e-119  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.505753  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2458  glycine dehydrogenase subunit 2  50.1 
 
 		 505 aa  429  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0293  glycine dehydrogenase subunit 2  49.27 
 
 		 491 aa  429  1e-119  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0348  glycine dehydrogenase subunit 2  51.03 
 
 		 488 aa  428  1e-118  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1593  glycine dehydrogenase subunit 2  50.83 
 
 		 478 aa  426  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.574541  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2755  glycine dehydrogenase subunit 2  51.04 
 
 		 496 aa  422  1e-117  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0392  glycine dehydrogenase subunit 2  50.63 
 
 		 479 aa  424  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.607987 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1624  glycine dehydrogenase subunit 2  51.1 
 
 		 482 aa  420  1e-116  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2496  glycine dehydrogenase subunit 2  50.31 
 
 		 486 aa  418  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0223  glycine dehydrogenase subunit 2  49.47 
 
 		 481 aa  419  1e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0566189 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2547  glycine dehydrogenase subunit 2  48.97 
 
 		 486 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0700  Glycine dehydrogenase (decarboxylating)  52.33 
 
 		 481 aa  415  9.999999999999999e-116  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1716  Glycine dehydrogenase (decarboxylating)  50 
 
 		 503 aa  417  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.658933 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0113  glycine dehydrogenase subunit 2  47.1 
 
 		 484 aa  414  1e-114  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1853  glycine dehydrogenase subunit 2  50.62 
 
 		 519 aa  412  1e-114  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0670601  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1652  glycine dehydrogenase subunit 2  48.31 
 
 		 481 aa  414  1e-114  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00329218  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2697  glycine dehydrogenase subunit 2  50.72 
 
 		 524 aa  408  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0128  glycine dehydrogenase subunit 2  46.89 
 
 		 484 aa  411  1e-113  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2671  glycine dehydrogenase subunit 2  48.85 
 
 		 481 aa  411  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0173  glycine dehydrogenase subunit 2  47.83 
 
 		 483 aa  409  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.267344 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1105  glycine dehydrogenase subunit 2  47.89 
 
 		 483 aa  409  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3152  glycine dehydrogenase subunit 2  49.69 
 
 		 481 aa  408  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1691  glycine dehydrogenase subunit 2  50.44 
 
 		 481 aa  412  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0190164  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0691  glycine dehydrogenase subunit 2  50.32 
 
 		 526 aa  411  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0336  glycine dehydrogenase subunit 2  50.31 
 
 		 481 aa  410  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2580  glycine dehydrogenase subunit 2  49.9 
 
 		 511 aa  410  1e-113  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025975  normal  0.0266723 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2208  glycine dehydrogenase subunit 2  49.17 
 
 		 526 aa  409  1e-113  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.283964  normal  0.12448 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3753  Glycine dehydrogenase (decarboxylating)  52.09 
 
 		 512 aa  406  1.0000000000000001e-112  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0902964 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3048  glycine dehydrogenase subunit 2  50.53 
 
 		 504 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.932595  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0736  glycine dehydrogenase subunit 2  49.38 
 
 		 518 aa  408  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.101381 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1561  glycine dehydrogenase subunit 2  50.11 
 
 		 491 aa  406  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1214  glycine dehydrogenase subunit 2  48.96 
 
 		 514 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467458 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0789  glycine dehydrogenase subunit 2  47.92 
 
 		 482 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4383  glycine dehydrogenase subunit 2  49.78 
 
 		 527 aa  400  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.798393 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1867  glycine dehydrogenase subunit 2  50.21 
 
 		 517 aa  399  9.999999999999999e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.359855  normal  0.134496 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1118  glycine dehydrogenase subunit 2  49.35 
 
 		 507 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1579  glycine dehydrogenase subunit 2  46.43 
 
 		 488 aa  398  1e-109  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1194  glycine dehydrogenase subunit 2  48.86 
 
 		 488 aa  397  1e-109  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2197  glycine dehydrogenase subunit 2  48.25 
 
 		 523 aa  394  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.268884  normal  0.291086 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0982  glycine dehydrogenase subunit 2  52.44 
 
 		 508 aa  393  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1096  glycine dehydrogenase subunit 2  52.44 
 
 		 483 aa  394  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.962704  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0378  glycine dehydrogenase subunit 2  48.74 
 
 		 481 aa  391  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1896  glycine dehydrogenase subunit 2  46.92 
 
 		 471 aa  372  1e-102  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.273631 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1665  glycine dehydrogenase subunit 2  44.28 
 
 		 496 aa  367  1e-100  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00835735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4144  Glycine dehydrogenase (decarboxylating)  48.17 
 
 		 474 aa  365  1e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0396  aminotransferase class V  46.83 
 
 		 499 aa  365  1e-99  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2314  Glycine dehydrogenase (decarboxylating)  47.5 
 
 		 507 aa  363  3e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1898  Glycine dehydrogenase (decarboxylating)  43.19 
 
 		 508 aa  356  3.9999999999999996e-97  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1610  glycine dehydrogenase subunit 2  46.7 
 
 		 476 aa  338  9.999999999999999e-92  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.731117  normal  0.416595 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>