More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2731 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2458  glycine dehydrogenase subunit 2  66.79 
 
 		 531 aa  721    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2731  glycine dehydrogenase subunit 2  100 
 
 		 532 aa  1097    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0541942  normal  0.0898713 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2033  glycine dehydrogenase subunit 2  72.21 
 
 		 523 aa  793    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00105152  normal  0.440854 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7698  glycine dehydrogenase subunit 2  70.13 
 
 		 519 aa  757    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.539443 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1798  glycine dehydrogenase subunit 2  47.16 
 
 		 487 aa  375  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0216  glycine dehydrogenase subunit 2  42.53 
 
 		 490 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0210  glycine dehydrogenase subunit 2  40.72 
 
 		 500 aa  355  8.999999999999999e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.37883  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2359  glycine dehydrogenase subunit 2  42.71 
 
 		 485 aa  351  2e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000690583  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23410  glycine dehydrogenase subunit 2  41.47 
 
 		 479 aa  348  1e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0423957  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1942  glycine dehydrogenase subunit 2  43.82 
 
 		 485 aa  348  2e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000124327  hitchhiker  0.000000296653 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0974  glycine dehydrogenase subunit 2  38.98 
 
 		 477 aa  346  6e-94  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1980  glycine dehydrogenase subunit 2  43.28 
 
 		 486 aa  344  2e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0229  glycine dehydrogenase subunit 2  40.84 
 
 		 484 aa  341  2e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1357  Glycine dehydrogenase (decarboxylating)  42.71 
 
 		 483 aa  339  8e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1100  glycine dehydrogenase subunit 2  42.26 
 
 		 502 aa  338  1.9999999999999998e-91  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2913  glycine dehydrogenase subunit 2  41.37 
 
 		 491 aa  336  5.999999999999999e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000385002  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1593  glycine dehydrogenase subunit 2  41.26 
 
 		 490 aa  334  2e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.243089  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1626  glycine dehydrogenase subunit 2  41.26 
 
 		 490 aa  334  2e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0128  glycine dehydrogenase subunit 2  40.51 
 
 		 484 aa  332  1e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0903  glycine dehydrogenase subunit 2  40.17 
 
 		 491 aa  332  1e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000134487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0173  glycine dehydrogenase subunit 2  42.41 
 
 		 483 aa  332  1e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.267344 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1914  glycine dehydrogenase subunit 2  38.69 
 
 		 478 aa  332  1e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.453538  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4337  glycine dehydrogenase subunit 2  40.38 
 
 		 491 aa  332  1e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00444907  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4080  glycine dehydrogenase subunit 2  40.38 
 
 		 491 aa  332  1e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000357312  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0348  glycine dehydrogenase subunit 2  43.07 
 
 		 488 aa  331  2e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0700  Glycine dehydrogenase (decarboxylating)  41.63 
 
 		 481 aa  331  2e-89  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4129  glycine dehydrogenase subunit 2  40.38 
 
 		 491 aa  330  3e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.289534  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3969  glycine dehydrogenase subunit 2  40.38 
 
 		 491 aa  330  3e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000695556  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3979  glycine dehydrogenase subunit 2  40.38 
 
 		 491 aa  330  3e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00103268  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4447  glycine dehydrogenase subunit 2  40.38 
 
 		 491 aa  330  3e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00139398  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4245  glycine dehydrogenase subunit 2  40.38 
 
 		 491 aa  330  3e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4356  glycine dehydrogenase subunit 2  40.38 
 
 		 491 aa  330  4e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000339939  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4303  glycine dehydrogenase subunit 2  40.38 
 
 		 491 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000146938  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1665  glycine dehydrogenase subunit 2  38.11 
 
 		 496 aa  328  1.0000000000000001e-88  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00835735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2748  glycine dehydrogenase subunit 2  38.74 
 
 		 488 aa  328  2.0000000000000001e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0113  glycine dehydrogenase subunit 2  40.3 
 
 		 484 aa  328  2.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1887  glycine dehydrogenase subunit 2  38.64 
 
 		 481 aa  327  3e-88  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4036  glycine dehydrogenase subunit 2  40.83 
 
 		 487 aa  327  3e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1898  Glycine dehydrogenase (decarboxylating)  37.5 
 
 		 508 aa  327  4.0000000000000003e-88  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2871  glycine dehydrogenase subunit 2  41.67 
 
 		 489 aa  325  1e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0723  glycine dehydrogenase subunit 2  40.63 
 
 		 484 aa  324  2e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0355451  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0249  glycine dehydrogenase subunit 2  42 
 
 		 491 aa  325  2e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.494038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0734  glycine dehydrogenase subunit 2  39.32 
 
 		 474 aa  323  3e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0171  glycine dehydrogenase subunit 2  40 
 
 		 487 aa  322  9.999999999999999e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.939374 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0710  glycine dehydrogenase subunit 2  39.19 
 
 		 474 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1658  glycine dehydrogenase subunit 2  39.83 
 
 		 481 aa  319  7.999999999999999e-86  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2755  glycine dehydrogenase subunit 2  40.04 
 
 		 496 aa  317  2e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1624  glycine dehydrogenase subunit 2  40.08 
 
 		 482 aa  316  8e-85  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0127  glycine dehydrogenase subunit 2  39.59 
 
 		 508 aa  315  9e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2580  glycine dehydrogenase subunit 2  41.21 
 
 		 511 aa  313  5.999999999999999e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025975  normal  0.0266723 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1096  glycine dehydrogenase subunit 2  42.35 
 
 		 483 aa  310  5.9999999999999995e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.962704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1716  Glycine dehydrogenase (decarboxylating)  40.94 
 
 		 503 aa  309  6.999999999999999e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.658933 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0982  glycine dehydrogenase subunit 2  42.35 
 
 		 508 aa  309  9e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2547  glycine dehydrogenase subunit 2  37.73 
 
 		 486 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2496  glycine dehydrogenase subunit 2  40.5 
 
 		 486 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0163  glycine dehydrogenase subunit 2  39.79 
 
 		 486 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.546611  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0179  glycine dehydrogenase subunit 2  40.34 
 
 		 482 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.505753  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1561  glycine dehydrogenase subunit 2  40 
 
 		 491 aa  308  2.0000000000000002e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1194  glycine dehydrogenase subunit 2  41.14 
 
 		 488 aa  306  6e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1518  glycine dehydrogenase subunit 2  40.67 
 
 		 480 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0293  glycine dehydrogenase subunit 2  38.03 
 
 		 491 aa  305  2.0000000000000002e-81  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1900  glycine dehydrogenase subunit 2  38.03 
 
 		 491 aa  305  2.0000000000000002e-81  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3753  Glycine dehydrogenase (decarboxylating)  41.96 
 
 		 512 aa  302  9e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0902964 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2623  glycine dehydrogenase subunit 2  40.49 
 
 		 522 aa  302  1e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2002  Glycine dehydrogenase (decarboxylating)  42.06 
 
 		 484 aa  301  2e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2458  glycine dehydrogenase subunit 2  38.7 
 
 		 505 aa  301  2e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0398  glycine dehydrogenase subunit 2  40.62 
 
 		 479 aa  301  2e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1242  glycine dehydrogenase subunit 2  40.17 
 
 		 492 aa  300  3e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2596  Glycine dehydrogenase (decarboxylating)  36.69 
 
 		 491 aa  298  2e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2717  glycine dehydrogenase subunit 2  39.88 
 
 		 522 aa  296  5e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4144  Glycine dehydrogenase (decarboxylating)  43.02 
 
 		 474 aa  295  1e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2281  glycine dehydrogenase subunit 2  39 
 
 		 518 aa  295  1e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.900236  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1579  glycine dehydrogenase subunit 2  39.12 
 
 		 488 aa  295  2e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1541  glycine dehydrogenase subunit 2  37.21 
 
 		 486 aa  293  5e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.136529  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1522  glycine dehydrogenase subunit 2  39 
 
 		 517 aa  290  4e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.689584  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0223  glycine dehydrogenase subunit 2  39.75 
 
 		 481 aa  288  1e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0566189 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0396  aminotransferase class V  42.16 
 
 		 499 aa  288  2e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0392  glycine dehydrogenase subunit 2  40.08 
 
 		 479 aa  286  5e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.607987 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1896  glycine dehydrogenase subunit 2  40.45 
 
 		 471 aa  284  3.0000000000000004e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.273631 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0336  glycine dehydrogenase subunit 2  40.38 
 
 		 481 aa  283  6.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2525  glycine dehydrogenase subunit 2  38.69 
 
 		 522 aa  280  6e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.184329 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2671  glycine dehydrogenase subunit 2  38.96 
 
 		 481 aa  279  1e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1691  glycine dehydrogenase subunit 2  38.46 
 
 		 481 aa  277  3e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0190164  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1351  glycine dehydrogenase subunit 2  36.46 
 
 		 482 aa  277  3e-73  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.3112 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2314  Glycine dehydrogenase (decarboxylating)  42.02 
 
 		 507 aa  274  3e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1593  glycine dehydrogenase subunit 2  38.25 
 
 		 478 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.574541  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1652  glycine dehydrogenase subunit 2  37.66 
 
 		 481 aa  267  4e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00329218  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3152  glycine dehydrogenase subunit 2  37.79 
 
 		 481 aa  265  2e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1105  glycine dehydrogenase subunit 2  36.88 
 
 		 483 aa  264  3e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4383  glycine dehydrogenase subunit 2  37.01 
 
 		 527 aa  259  1e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.798393 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0789  glycine dehydrogenase subunit 2  36.5 
 
 		 482 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1610  glycine dehydrogenase subunit 2  41.12 
 
 		 476 aa  254  3e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.731117  normal  0.416595 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2697  glycine dehydrogenase subunit 2  35.92 
 
 		 524 aa  252  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3185  glycine dehydrogenase subunit 2  38.45 
 
 		 471 aa  252  2e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00205794  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2197  glycine dehydrogenase subunit 2  36.56 
 
 		 523 aa  248  2e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.268884  normal  0.291086 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0691  glycine dehydrogenase subunit 2  37.82 
 
 		 526 aa  248  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1867  glycine dehydrogenase subunit 2  35.5 
 
 		 517 aa  248  3e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.359855  normal  0.134496 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1118  glycine dehydrogenase subunit 2  37.27 
 
 		 507 aa  246  8e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3048  glycine dehydrogenase subunit 2  36.33 
 
 		 504 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.932595  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1853  glycine dehydrogenase subunit 2  35.36 
 
 		 519 aa  244  1.9999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0670601  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>