21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6272 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_6272  glycosyl transferase family 14  100 
 
 		 302 aa  622  1e-177  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0169  glycosyl transferase family 14  31.48 
 
 		 294 aa  94.7  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0678  glycosyl transferase family 14  27.36 
 
 		 525 aa  89  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.785875  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1979  glycosyl transferase family 14  25.08 
 
 		 277 aa  87  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.178654  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2488  glycosyl transferase family protein  27.33 
 
 		 525 aa  86.3  6e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.80194  normal  0.91417 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1857  glycosyl transferase family protein  26.96 
 
 		 529 aa  85.9  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1001  hypothetical protein  30.03 
 
 		 307 aa  85.5  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.580555 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2457  glycosyl transferase family 14  29.41 
 
 		 330 aa  82.8  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00687253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0019  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 566 aa  76.6  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00457408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1973  glycosyl transferase family 14  24.67 
 
 		 286 aa  76.6  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000218843 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2293  glycosyl transferase family protein  29.65 
 
 		 566 aa  66.6  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.543368  normal  0.309051 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3249  glycosyl transferase family protein  25.58 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0798457  normal  0.508219 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0221  glycosyl transferase family protein  26.36 
 
 		 566 aa  64.3  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.780402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1678  EpsK domain-containing protein  24.26 
 
 		 525 aa  62  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3809  hypothetical protein  23.5 
 
 		 284 aa  62.4  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23218  normal  0.809451 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2434  glycosyl transferase family 14  27.93 
 
 		 302 aa  57  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3102  glycosyl transferase family 14  25.59 
 
 		 309 aa  52  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3580  core-2/I-branching enzyme family protein  30.94 
 
 		 495 aa  50.1  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1018  glycosyl transferase family 14  21.92 
 
 		 290 aa  47  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43615  predicted protein  23.87 
 
 		 811 aa  45.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0555808  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0861  xylosyltransferase  23.53 
 
 		 300 aa  45.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.487622  normal  0.0646646 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>