21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1857 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2488  glycosyl transferase family protein  61.6 
 
 		 525 aa  684    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.80194  normal  0.91417 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1857  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 529 aa  1084    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0678  glycosyl transferase family 14  60.95 
 
 		 525 aa  665    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.785875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1678  EpsK domain-containing protein  57.52 
 
 		 525 aa  631  1e-180  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0221  glycosyl transferase family protein  37.37 
 
 		 566 aa  176  9.999999999999999e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.780402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2293  glycosyl transferase family protein  37.05 
 
 		 566 aa  169  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.543368  normal  0.309051 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0019  glycosyl transferase family protein  35.59 
 
 		 566 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00457408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3580  core-2/I-branching enzyme family protein  37.74 
 
 		 495 aa  140  4.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1001  hypothetical protein  31.1 
 
 		 307 aa  110  9.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.580555 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0169  glycosyl transferase family 14  27.17 
 
 		 294 aa  103  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2457  glycosyl transferase family 14  27.48 
 
 		 330 aa  86.7  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00687253  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6272  glycosyl transferase family 14  26.96 
 
 		 302 aa  85.9  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1979  glycosyl transferase family 14  23.78 
 
 		 277 aa  67.4  0.0000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.178654  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1973  glycosyl transferase family 14  19.64 
 
 		 286 aa  64.7  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000218843 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2434  glycosyl transferase family 14  26.13 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3102  glycosyl transferase family 14  25.86 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1018  glycosyl transferase family 14  23.33 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3809  hypothetical protein  20 
 
 		 284 aa  49.3  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23218  normal  0.809451 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3136  glycosyl transferase family 14  24.75 
 
 		 501 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.213491  normal  0.217481 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0861  xylosyltransferase  25.16 
 
 		 300 aa  48.5  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.487622  normal  0.0646646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3249  glycosyl transferase family protein  24.91 
 
 		 309 aa  48.1  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0798457  normal  0.508219 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>