20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2488 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1678  EpsK domain-containing protein  59.81 
 
 		 525 aa  663    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2488  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 525 aa  1085    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.80194  normal  0.91417 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1857  glycosyl transferase family protein  61.6 
 
 		 529 aa  684    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0678  glycosyl transferase family 14  64.76 
 
 		 525 aa  719    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.785875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0019  glycosyl transferase family protein  35.29 
 
 		 566 aa  189  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00457408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2293  glycosyl transferase family protein  36.42 
 
 		 566 aa  187  5e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.543368  normal  0.309051 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0221  glycosyl transferase family protein  37.43 
 
 		 566 aa  185  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.780402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3580  core-2/I-branching enzyme family protein  39.15 
 
 		 495 aa  152  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1001  hypothetical protein  28.93 
 
 		 307 aa  109  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.580555 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0169  glycosyl transferase family 14  25.93 
 
 		 294 aa  94  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2457  glycosyl transferase family 14  27.39 
 
 		 330 aa  89  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00687253  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6272  glycosyl transferase family 14  27.33 
 
 		 302 aa  86.3  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1979  glycosyl transferase family 14  26.92 
 
 		 277 aa  78.2  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.178654  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3102  glycosyl transferase family 14  24.67 
 
 		 309 aa  70.1  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1018  glycosyl transferase family 14  22.15 
 
 		 290 aa  65.9  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2434  glycosyl transferase family 14  26.01 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1973  glycosyl transferase family 14  20.52 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000218843 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3809  hypothetical protein  24.02 
 
 		 284 aa  50.8  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23218  normal  0.809451 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3136  glycosyl transferase family 14  25.23 
 
 		 501 aa  47.4  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.213491  normal  0.217481 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43615  predicted protein  22.19 
 
 		 811 aa  43.9  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0555808  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>