21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0678 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1678  EpsK domain-containing protein  60.95 
 
 		 525 aa  684    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2488  glycosyl transferase family protein  64.76 
 
 		 525 aa  719    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.80194  normal  0.91417 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1857  glycosyl transferase family protein  60.95 
 
 		 529 aa  665    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0678  glycosyl transferase family 14  100 
 
 		 525 aa  1075    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.785875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2293  glycosyl transferase family protein  39.48 
 
 		 566 aa  185  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.543368  normal  0.309051 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0019  glycosyl transferase family protein  36.07 
 
 		 566 aa  179  1e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00457408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0221  glycosyl transferase family protein  35.36 
 
 		 566 aa  174  1.9999999999999998e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.780402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3580  core-2/I-branching enzyme family protein  37.74 
 
 		 495 aa  138  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1001  hypothetical protein  31.27 
 
 		 307 aa  116  7.999999999999999e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.580555 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0169  glycosyl transferase family 14  27.76 
 
 		 294 aa  103  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6272  glycosyl transferase family 14  27.36 
 
 		 302 aa  89  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2457  glycosyl transferase family 14  26.73 
 
 		 330 aa  86.3  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00687253  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1979  glycosyl transferase family 14  25.6 
 
 		 277 aa  80.5  0.00000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.178654  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3136  glycosyl transferase family 14  31.53 
 
 		 501 aa  70.5  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.213491  normal  0.217481 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1973  glycosyl transferase family 14  21.15 
 
 		 286 aa  68.9  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000218843 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2434  glycosyl transferase family 14  25.85 
 
 		 302 aa  66.6  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1018  glycosyl transferase family 14  22.84 
 
 		 290 aa  63.5  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3102  glycosyl transferase family 14  25.76 
 
 		 309 aa  61.6  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46768  predicted protein  23.44 
 
 		 455 aa  50.1  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3809  hypothetical protein  19.87 
 
 		 284 aa  43.5  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23218  normal  0.809451 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0861  xylosyltransferase  24.07 
 
 		 300 aa  43.5  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.487622  normal  0.0646646 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>