22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1001 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1001  hypothetical protein  100 
 
 		 307 aa  629  1e-179  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.580555 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0169  glycosyl transferase family 14  35.49 
 
 		 294 aa  161  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3102  glycosyl transferase family 14  32.07 
 
 		 309 aa  135  9e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1979  glycosyl transferase family 14  32.18 
 
 		 277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.178654  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1973  glycosyl transferase family 14  28.03 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000218843 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0678  glycosyl transferase family 14  31.27 
 
 		 525 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.785875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1857  glycosyl transferase family protein  31.1 
 
 		 529 aa  110  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2488  glycosyl transferase family protein  28.93 
 
 		 525 aa  109  7.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.80194  normal  0.91417 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2457  glycosyl transferase family 14  27.06 
 
 		 330 aa  108  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00687253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3249  glycosyl transferase family protein  32.4 
 
 		 309 aa  107  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0798457  normal  0.508219 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1018  glycosyl transferase family 14  29.23 
 
 		 290 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0221  glycosyl transferase family protein  28.44 
 
 		 566 aa  103  5e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.780402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0019  glycosyl transferase family protein  29.45 
 
 		 566 aa  102  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00457408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1678  EpsK domain-containing protein  31.96 
 
 		 525 aa  100  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2434  glycosyl transferase family 14  27.36 
 
 		 302 aa  99  8e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2293  glycosyl transferase family protein  30.09 
 
 		 566 aa  97.1  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.543368  normal  0.309051 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43615  predicted protein  28.94 
 
 		 811 aa  96.7  4e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0555808  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6272  glycosyl transferase family 14  30.03 
 
 		 302 aa  85.5  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3136  glycosyl transferase family 14  27.16 
 
 		 501 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.213491  normal  0.217481 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3580  core-2/I-branching enzyme family protein  32.47 
 
 		 495 aa  64.3  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0861  xylosyltransferase  24.04 
 
 		 300 aa  51.6  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.487622  normal  0.0646646 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3809  hypothetical protein  23.57 
 
 		 284 aa  50.4  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23218  normal  0.809451 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>