More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2761 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1423  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  72.48 
 
 		 487 aa  721    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0291  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  69.94 
 
 		 487 aa  686    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1620  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  81.8 
 
 		 489 aa  814    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.690045 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1429  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  71.57 
 
 		 487 aa  716    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0657932  normal  0.0240553 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00905  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  65.98 
 
 		 485 aa  659    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0297709  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1246  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  88.19 
 
 		 491 aa  885    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1449  inosine-5-monophosphate dehydrogenase  67.28 
 
 		 489 aa  635    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327774  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1035  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  67.89 
 
 		 486 aa  641    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1524  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  71.37 
 
 		 486 aa  722    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.048391  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1688  hypothetical protein  63.14 
 
 		 490 aa  652    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1687  hypothetical protein  63.14 
 
 		 490 aa  653    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1261  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  67.28 
 
 		 489 aa  642    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1360  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  63.08 
 
 		 490 aa  645    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2338  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  71.22 
 
 		 487 aa  710    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.879992  normal  0.100057 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1453  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  66.26 
 
 		 486 aa  657    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.136087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1856  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  72.07 
 
 		 487 aa  728    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1682  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  66.6 
 
 		 514 aa  663    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.155444  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1752  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  71.78 
 
 		 486 aa  691    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.853386 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2549  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  71.37 
 
 		 486 aa  722    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.425317  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0613  IMP dehydrogenase  65.5 
 
 		 486 aa  667    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000830235  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4588  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  67.28 
 
 		 489 aa  639    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2405  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  71.37 
 
 		 486 aa  722    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.323419  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5301  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  71.17 
 
 		 486 aa  721    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.446018  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1261  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  63.75 
 
 		 490 aa  644    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.289977  normal  0.031693 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2761  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  100 
 
 		 489 aa  989    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1306  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  73.1 
 
 		 487 aa  729    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24376  normal  0.894393 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1260  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  87.17 
 
 		 491 aa  835    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1616  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  63.39 
 
 		 486 aa  636    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1589  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  65.5 
 
 		 485 aa  658    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1200  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  67.56 
 
 		 486 aa  696    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.608786  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1893  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  70.96 
 
 		 486 aa  719    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0489208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2056  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  71.98 
 
 		 486 aa  724    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2548  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  87.17 
 
 		 491 aa  835    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685528 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0609  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  67.69 
 
 		 486 aa  675    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.050446  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1285  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  70.96 
 
 		 486 aa  703    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0259426  normal  0.434243 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2288  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  88.14 
 
 		 489 aa  893    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.453935  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1459  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  63.52 
 
 		 556 aa  640    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.439962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1141  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  72.9 
 
 		 486 aa  734    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.144187 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2440  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  87.12 
 
 		 489 aa  859    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1706  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  70.76 
 
 		 486 aa  717    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1370  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  72.9 
 
 		 487 aa  728    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.810739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1913  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  67.08 
 
 		 486 aa  655    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0730  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  65.71 
 
 		 489 aa  640    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1005  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  63.08 
 
 		 490 aa  645    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1461  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  71.05 
 
 		 487 aa  712    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1295  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  71.37 
 
 		 486 aa  722    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2457  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  71.37 
 
 		 486 aa  722    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195801  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3486  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  68.1 
 
 		 489 aa  676    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6086  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  70.96 
 
 		 486 aa  718    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3370  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  90.39 
 
 		 489 aa  906    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2024  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  71.37 
 
 		 486 aa  722    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.637626  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1532  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  65.5 
 
 		 485 aa  658    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1777  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  66.26 
 
 		 486 aa  657    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.814385  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1014  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  65.64 
 
 		 488 aa  652    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2011  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  70.76 
 
 		 486 aa  715    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.438138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2024  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  70.96 
 
 		 486 aa  719    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.363824  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1728  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  67.35 
 
 		 494 aa  655    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.716764  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1991  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  70.96 
 
 		 486 aa  718    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.287012  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2061  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  82.62 
 
 		 489 aa  818    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0144949 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1314  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  70.76 
 
 		 486 aa  726    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3287  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  71.37 
 
 		 486 aa  722    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00821787  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3008  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  86.76 
 
 		 491 aa  852    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0175212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0529  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  71.87 
 
 		 487 aa  726    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1670  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  65.03 
 
 		 485 aa  646    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0531396  normal  0.274941 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2431  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  70.96 
 
 		 486 aa  721    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.171445 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2001  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  87.73 
 
 		 489 aa  865    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.488937 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2623  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  71.46 
 
 		 487 aa  713    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39730  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  67.89 
 
 		 489 aa  629  1e-179  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.239623  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1031  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  67.48 
 
 		 489 aa  625  1e-178  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1071  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  67.48 
 
 		 489 aa  625  1e-178  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4194  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  67.28 
 
 		 489 aa  623  1e-177  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1029  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  67.28 
 
 		 489 aa  621  1e-177  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3120  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  62.24 
 
 		 489 aa  622  1e-177  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.899033  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0420  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  61.27 
 
 		 487 aa  621  1e-177  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4148  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  62.78 
 
 		 488 aa  618  1e-176  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0201579  normal  0.112689 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1346  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  66.46 
 
 		 489 aa  616  1e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.43014  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1137  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.08 
 
 		 488 aa  614  1e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00151864  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15310  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  66.46 
 
 		 489 aa  616  1e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.10306  hitchhiker  4.2499e-17 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1108  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.7 
 
 		 485 aa  612  9.999999999999999e-175  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.927877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1217  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.33 
 
 		 491 aa  610  1e-173  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0296  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.63 
 
 		 489 aa  608  1e-173  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1495  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.71 
 
 		 489 aa  608  1e-173  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.939383  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1431  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.71 
 
 		 489 aa  608  1e-173  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0514  response regulator receiver protein  60.21 
 
 		 484 aa  606  9.999999999999999e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135977  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2195  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.07 
 
 		 491 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4242  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  62.24 
 
 		 490 aa  604  1.0000000000000001e-171  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.953996  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1559  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.67 
 
 		 490 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.554921  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1639  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.38 
 
 		 488 aa  603  1.0000000000000001e-171  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0762082  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3293  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.53 
 
 		 488 aa  601  1e-170  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1615  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.21 
 
 		 487 aa  598  1e-170  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2349  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.42 
 
 		 487 aa  600  1e-170  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.163967  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2646  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.33 
 
 		 488 aa  598  1e-170  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1260  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.22 
 
 		 499 aa  598  1e-170  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.334206 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1524  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.63 
 
 		 487 aa  598  1e-170  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1234  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.53 
 
 		 488 aa  599  1e-170  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1305  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.53 
 
 		 488 aa  599  1e-170  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1313  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.71 
 
 		 490 aa  598  1e-170  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.905009  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1235  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.53 
 
 		 488 aa  600  1e-170  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.916768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2359  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.45 
 
 		 488 aa  598  1e-170  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.885257 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1520  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  58.8 
 
 		 487 aa  595  1e-169  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0307442  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>