26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002740 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_002740  hypothetical protein  100 
 
 
345 aa  708    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0801245  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03242  hypothetical protein  88.12 
 
 
345 aa  639    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0409  hypothetical protein  66.09 
 
 
345 aa  462  1e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.549851  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0711  hypothetical protein  59.71 
 
 
346 aa  432  1e-120  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.867065  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0833  hypothetical protein  38.87 
 
 
346 aa  234  1.0000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.124612  normal  0.132883 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2645  hypothetical protein  39.6 
 
 
337 aa  231  9e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.798994 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1129  hypothetical protein  36.99 
 
 
337 aa  228  1e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.331112  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2826  hypothetical protein  39.42 
 
 
337 aa  225  7e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2652  hypothetical protein  39.13 
 
 
337 aa  224  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2719  hypothetical protein  39.07 
 
 
337 aa  222  8e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3171  hypothetical protein  37.57 
 
 
337 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2893  hypothetical protein  37.43 
 
 
337 aa  217  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.236173  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1260  hypothetical protein  36.81 
 
 
337 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0945174  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3651  hypothetical protein  35.28 
 
 
350 aa  212  5.999999999999999e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1618  hypothetical protein  36.52 
 
 
337 aa  212  7e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1440  hypothetical protein  35.94 
 
 
337 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2913  hypothetical protein  36.23 
 
 
337 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0571999  normal  0.912029 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1337  hypothetical protein  35.94 
 
 
337 aa  207  3e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1434  hypothetical protein  35.94 
 
 
337 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1470  hypothetical protein  36.78 
 
 
337 aa  206  5e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00893038  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3291  hypothetical protein  36.31 
 
 
337 aa  205  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.679311  hitchhiker  0.00000349841 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1544  hypothetical protein  35.35 
 
 
347 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3186  hypothetical protein  29.45 
 
 
341 aa  171  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.173112  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1242  hypothetical protein  31.23 
 
 
344 aa  153  4e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000592116  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03039  hypothetical protein  30.75 
 
 
349 aa  135  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.642402  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1749  hypothetical protein  32.31 
 
 
361 aa  132  9e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>