26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3171 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3171  hypothetical protein  100 
 
 		 337 aa  697    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3291  hypothetical protein  75.96 
 
 		 337 aa  543  1e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.679311  hitchhiker  0.00000349841 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2893  hypothetical protein  73 
 
 		 337 aa  522  1e-147  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.236173  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1337  hypothetical protein  70.57 
 
 		 337 aa  488  1e-137  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2645  hypothetical protein  69.14 
 
 		 337 aa  489  1e-137  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.798994 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1440  hypothetical protein  69.37 
 
 		 337 aa  484  1e-136  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2913  hypothetical protein  69.07 
 
 		 337 aa  481  1e-135  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0571999  normal  0.912029 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1470  hypothetical protein  69.67 
 
 		 337 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00893038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1434  hypothetical protein  69.37 
 
 		 337 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2826  hypothetical protein  67.76 
 
 		 337 aa  481  1e-135  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1618  hypothetical protein  67.27 
 
 		 337 aa  477  1e-133  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2719  hypothetical protein  67.57 
 
 		 337 aa  476  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2652  hypothetical protein  67.46 
 
 		 337 aa  477  1e-133  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1260  hypothetical protein  63.99 
 
 		 337 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0945174  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1129  hypothetical protein  60.24 
 
 		 337 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.331112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1544  hypothetical protein  60.81 
 
 		 347 aa  428  1e-119  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0833  hypothetical protein  41.3 
 
 		 346 aa  248  1e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.124612  normal  0.132883 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0409  hypothetical protein  39.08 
 
 		 345 aa  230  3e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.549851  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0711  hypothetical protein  39.6 
 
 		 346 aa  230  3e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.867065  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03242  hypothetical protein  37.28 
 
 		 345 aa  219  7e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002740  hypothetical protein  37.57 
 
 		 345 aa  218  7.999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0801245  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3651  hypothetical protein  35.19 
 
 		 350 aa  202  9.999999999999999e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3186  hypothetical protein  31.87 
 
 		 341 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.173112  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03039  hypothetical protein  32.46 
 
 		 349 aa  154  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.642402  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1242  hypothetical protein  31.25 
 
 		 344 aa  149  9e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000592116  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1749  hypothetical protein  30.11 
 
 		 361 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>