26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0833 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_0833  hypothetical protein  100 
 
 
346 aa  707    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.124612  normal  0.132883 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1440  hypothetical protein  42.98 
 
 
337 aa  256  4e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1434  hypothetical protein  42.98 
 
 
337 aa  255  6e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2913  hypothetical protein  42.69 
 
 
337 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0571999  normal  0.912029 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1470  hypothetical protein  42.98 
 
 
337 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00893038  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2893  hypothetical protein  41.81 
 
 
337 aa  253  3e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.236173  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1129  hypothetical protein  41.5 
 
 
337 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.331112  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2645  hypothetical protein  42.4 
 
 
337 aa  249  5e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.798994 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1544  hypothetical protein  42.37 
 
 
347 aa  248  7e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3171  hypothetical protein  41.3 
 
 
337 aa  248  1e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1337  hypothetical protein  43.27 
 
 
337 aa  245  9e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1260  hypothetical protein  40.99 
 
 
337 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0945174  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2652  hypothetical protein  42.4 
 
 
337 aa  242  6e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2826  hypothetical protein  41.81 
 
 
337 aa  241  1e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2719  hypothetical protein  42.52 
 
 
337 aa  241  1e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3651  hypothetical protein  38.01 
 
 
350 aa  239  4e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1618  hypothetical protein  41.23 
 
 
337 aa  237  2e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03242  hypothetical protein  38.56 
 
 
345 aa  236  6e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002740  hypothetical protein  38.87 
 
 
345 aa  234  1.0000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0801245  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0711  hypothetical protein  38.89 
 
 
346 aa  226  4e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.867065  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3291  hypothetical protein  38.35 
 
 
337 aa  224  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.679311  hitchhiker  0.00000349841 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0409  hypothetical protein  35.28 
 
 
345 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.549851  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3186  hypothetical protein  31.2 
 
 
341 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.173112  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1242  hypothetical protein  30.7 
 
 
344 aa  149  6e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000592116  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03039  hypothetical protein  30.77 
 
 
349 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.642402  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1749  hypothetical protein  25.49 
 
 
361 aa  126  5e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>