26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3186 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3186  hypothetical protein  100 
 
 		 341 aa  706    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.173112  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03039  hypothetical protein  41.6 
 
 		 349 aa  253  5.000000000000001e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.642402  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1129  hypothetical protein  32.95 
 
 		 337 aa  192  9e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.331112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2893  hypothetical protein  33.24 
 
 		 337 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.236173  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2645  hypothetical protein  34.8 
 
 		 337 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.798994 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3651  hypothetical protein  32.84 
 
 		 350 aa  182  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3291  hypothetical protein  32.16 
 
 		 337 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.679311  hitchhiker  0.00000349841 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1260  hypothetical protein  33.33 
 
 		 337 aa  176  5e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0945174  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0833  hypothetical protein  31.2 
 
 		 346 aa  175  9.999999999999999e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.124612  normal  0.132883 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1440  hypothetical protein  33.53 
 
 		 337 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1544  hypothetical protein  31.55 
 
 		 347 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2913  hypothetical protein  32.66 
 
 		 337 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0571999  normal  0.912029 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3171  hypothetical protein  31.87 
 
 		 337 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2719  hypothetical protein  33.14 
 
 		 337 aa  172  5e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2652  hypothetical protein  33.33 
 
 		 337 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2826  hypothetical protein  32.76 
 
 		 337 aa  172  9e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1434  hypothetical protein  33.24 
 
 		 337 aa  172  9e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1470  hypothetical protein  33.24 
 
 		 337 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00893038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002740  hypothetical protein  29.45 
 
 		 345 aa  171  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0801245  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03242  hypothetical protein  30.06 
 
 		 345 aa  168  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1337  hypothetical protein  31.12 
 
 		 337 aa  167  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0711  hypothetical protein  31.19 
 
 		 346 aa  166  4e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.867065  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1618  hypothetical protein  31.32 
 
 		 337 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0409  hypothetical protein  28.65 
 
 		 345 aa  159  8e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.549851  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1749  hypothetical protein  28.09 
 
 		 361 aa  138  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1242  hypothetical protein  26.67 
 
 		 344 aa  116  6e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000592116  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>