26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3291 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3291  hypothetical protein  100 
 
 		 337 aa  689    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.679311  hitchhiker  0.00000349841 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3171  hypothetical protein  75.96 
 
 		 337 aa  543  1e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2893  hypothetical protein  72.4 
 
 		 337 aa  509  1e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.236173  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2645  hypothetical protein  70.33 
 
 		 337 aa  483  1e-135  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.798994 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1337  hypothetical protein  69.37 
 
 		 337 aa  476  1e-133  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1470  hypothetical protein  67.86 
 
 		 337 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00893038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1434  hypothetical protein  67.56 
 
 		 337 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1440  hypothetical protein  67.56 
 
 		 337 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2913  hypothetical protein  67.26 
 
 		 337 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0571999  normal  0.912029 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1260  hypothetical protein  67.56 
 
 		 337 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0945174  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2652  hypothetical protein  66.87 
 
 		 337 aa  463  1e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2719  hypothetical protein  66.97 
 
 		 337 aa  461  1e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2826  hypothetical protein  66.37 
 
 		 337 aa  463  1e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1618  hypothetical protein  66.07 
 
 		 337 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1544  hypothetical protein  63.98 
 
 		 347 aa  448  1e-125  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1129  hypothetical protein  62.02 
 
 		 337 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.331112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0833  hypothetical protein  38.35 
 
 		 346 aa  224  1e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.124612  normal  0.132883 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0409  hypothetical protein  38.27 
 
 		 345 aa  223  4e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.549851  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0711  hypothetical protein  38.15 
 
 		 346 aa  219  6e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.867065  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03242  hypothetical protein  37.57 
 
 		 345 aa  209  4e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002740  hypothetical protein  36.31 
 
 		 345 aa  205  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0801245  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3651  hypothetical protein  35.48 
 
 		 350 aa  195  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3186  hypothetical protein  32.16 
 
 		 341 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.173112  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03039  hypothetical protein  33.82 
 
 		 349 aa  160  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.642402  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1242  hypothetical protein  30.47 
 
 		 344 aa  140  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000592116  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1749  hypothetical protein  28.33 
 
 		 361 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>