26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1337 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1337  hypothetical protein  100 
 
 
337 aa  686    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1470  hypothetical protein  85.46 
 
 
337 aa  596  1e-169  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00893038  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1440  hypothetical protein  84.87 
 
 
337 aa  594  1e-169  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2913  hypothetical protein  84.57 
 
 
337 aa  590  1e-168  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0571999  normal  0.912029 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1434  hypothetical protein  84.87 
 
 
337 aa  592  1e-168  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2652  hypothetical protein  83.38 
 
 
337 aa  585  1e-166  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2719  hypothetical protein  83.38 
 
 
337 aa  584  1e-166  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2826  hypothetical protein  83.09 
 
 
337 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1618  hypothetical protein  82.2 
 
 
337 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2893  hypothetical protein  71.77 
 
 
337 aa  494  1e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.236173  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3171  hypothetical protein  70.57 
 
 
337 aa  488  1e-137  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3291  hypothetical protein  69.37 
 
 
337 aa  476  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.679311  hitchhiker  0.00000349841 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2645  hypothetical protein  66.37 
 
 
337 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.798994 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1260  hypothetical protein  64.88 
 
 
337 aa  449  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0945174  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1544  hypothetical protein  66.09 
 
 
347 aa  437  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1129  hypothetical protein  61.98 
 
 
337 aa  434  1e-120  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.331112  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0833  hypothetical protein  43.27 
 
 
346 aa  245  9e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.124612  normal  0.132883 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0711  hypothetical protein  38.24 
 
 
346 aa  211  2e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.867065  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0409  hypothetical protein  36.99 
 
 
345 aa  210  3e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.549851  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03242  hypothetical protein  37.07 
 
 
345 aa  208  1e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002740  hypothetical protein  35.94 
 
 
345 aa  207  3e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0801245  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3651  hypothetical protein  35.8 
 
 
350 aa  196  6e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3186  hypothetical protein  31.12 
 
 
341 aa  167  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.173112  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03039  hypothetical protein  33.14 
 
 
349 aa  161  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.642402  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1242  hypothetical protein  32.22 
 
 
344 aa  152  7e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000592116  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1749  hypothetical protein  28.85 
 
 
361 aa  124  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>