26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2652 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1618  hypothetical protein  91.1 
 
 		 337 aa  636    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2826  hypothetical protein  98.22 
 
 		 337 aa  677    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2719  hypothetical protein  99.41 
 
 		 337 aa  684    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2652  hypothetical protein  100 
 
 		 337 aa  688    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1337  hypothetical protein  83.38 
 
 		 337 aa  585  1e-166  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1470  hypothetical protein  80.71 
 
 		 337 aa  568  1e-161  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00893038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1440  hypothetical protein  80.71 
 
 		 337 aa  566  1e-160  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1434  hypothetical protein  80.12 
 
 		 337 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2913  hypothetical protein  79.82 
 
 		 337 aa  560  1e-158  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0571999  normal  0.912029 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2893  hypothetical protein  69.05 
 
 		 337 aa  484  1e-136  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.236173  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3171  hypothetical protein  67.46 
 
 		 337 aa  477  1e-133  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2645  hypothetical protein  67.46 
 
 		 337 aa  472  1e-132  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.798994 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3291  hypothetical protein  66.87 
 
 		 337 aa  463  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.679311  hitchhiker  0.00000349841 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1260  hypothetical protein  64.58 
 
 		 337 aa  451  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0945174  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1544  hypothetical protein  65.22 
 
 		 347 aa  435  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1129  hypothetical protein  60.6 
 
 		 337 aa  431  1e-120  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.331112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0833  hypothetical protein  42.4 
 
 		 346 aa  242  6e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.124612  normal  0.132883 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002740  hypothetical protein  39.13 
 
 		 345 aa  224  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0801245  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03242  hypothetical protein  38.55 
 
 		 345 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0711  hypothetical protein  39.42 
 
 		 346 aa  217  2e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.867065  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0409  hypothetical protein  38.66 
 
 		 345 aa  215  9e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.549851  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3651  hypothetical protein  33.14 
 
 		 350 aa  184  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3186  hypothetical protein  33.33 
 
 		 341 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.173112  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03039  hypothetical protein  32.29 
 
 		 349 aa  153  5e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.642402  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1242  hypothetical protein  31.71 
 
 		 344 aa  145  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000592116  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1749  hypothetical protein  28.93 
 
 		 361 aa  124  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>