More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0240 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011374  UUR10_0240  30S ribosomal protein S8  100 
 
 
132 aa  266  7e-71  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3891  30S ribosomal protein S8  49.62 
 
 
135 aa  138  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0945  ribosomal protein S8  49.61 
 
 
132 aa  134  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.26193  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1137  ribosomal protein S8  53.49 
 
 
132 aa  134  4e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1731  30S ribosomal protein S8  50 
 
 
132 aa  134  6.0000000000000005e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000337802  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1336  30S ribosomal protein S8  50.39 
 
 
132 aa  133  7.000000000000001e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000316434  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4493  ribosomal protein S8  48.48 
 
 
136 aa  133  9e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3403  ribosomal protein S8  50.39 
 
 
132 aa  132  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.337748  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3692  ribosomal protein S8  49.61 
 
 
132 aa  132  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0000284397  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0576  30S ribosomal protein S8  48.06 
 
 
132 aa  132  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5033  30S ribosomal protein S8  49.61 
 
 
132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000369377  normal  0.531992 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0729  ribosomal protein S8  45.74 
 
 
134 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3653  30S ribosomal protein S8  50.77 
 
 
133 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00001719  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6035  30S ribosomal protein S8  50.38 
 
 
135 aa  132  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.074261 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6600  ribosomal protein S8  50.39 
 
 
132 aa  131  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04120  SSU ribosomal protein S8P  48.06 
 
 
132 aa  131  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1058  30S ribosomal protein S8  48.84 
 
 
132 aa  130  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000455347  normal  0.366439 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1029  30S ribosomal protein S8  48.84 
 
 
132 aa  130  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000138076  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1046  30S ribosomal protein S8  48.84 
 
 
132 aa  130  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000643761  normal  0.194021 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10732  30S ribosomal protein S8  48.06 
 
 
132 aa  130  5e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.697308  normal  0.840798 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4307  ribosomal protein S8  48.84 
 
 
132 aa  130  5e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.550875  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1560  ribosomal protein S8  48.12 
 
 
131 aa  130  6.999999999999999e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00168005  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2632  30S ribosomal protein S8  48.06 
 
 
132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.17852  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0320  SSU ribosomal protein S8P  45.52 
 
 
134 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00355814 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0702  30S ribosomal protein S8  48.06 
 
 
132 aa  129  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0596  30S ribosomal protein S8  47.73 
 
 
136 aa  129  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0881  30S ribosomal protein S8  49.23 
 
 
132 aa  128  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.242013  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0304  30S ribosomal protein S8  50.39 
 
 
132 aa  128  3e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.2871700000000001e-28 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3909  30S ribosomal protein S8  45.8 
 
 
135 aa  128  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.239493  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1100  30S ribosomal protein S8  46.51 
 
 
132 aa  128  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2164  ribosomal protein S8  47.29 
 
 
132 aa  127  4.0000000000000003e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00791541  normal  0.949084 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1147  ribosomal protein S8  48.06 
 
 
132 aa  127  4.0000000000000003e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000686706  hitchhiker  0.00453997 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4301  30S ribosomal protein S8  45.8 
 
 
135 aa  127  4.0000000000000003e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.660154  hitchhiker  0.00325802 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1199  30S ribosomal protein S8  45.04 
 
 
135 aa  127  6e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0257081 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17030  SSU ribosomal protein S8P  47.29 
 
 
132 aa  126  8.000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000000158451  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0601  ribosomal protein S8  46.51 
 
 
132 aa  126  9.000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.468226  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2645  ribosomal protein S8  46.51 
 
 
132 aa  126  9.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23660  SSU ribosomal protein S8P  46.51 
 
 
132 aa  126  9.000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.06742  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09860  SSU ribosomal protein S8P  47.29 
 
 
132 aa  126  9.000000000000001e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00958102  hitchhiker  0.0000136856 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf428  ribosomal protein S8  47.37 
 
 
137 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20730  SSU ribosomal protein S8P  48.84 
 
 
132 aa  126  1.0000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0277  30S ribosomal protein S8  48.18 
 
 
136 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00362239  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2697  ribosomal protein S8  48.87 
 
 
131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0412  ribosomal protein S8  43.18 
 
 
136 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0641  ribosomal protein S8  45.74 
 
 
132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.968083  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1893  30S ribosomal protein S8  48.46 
 
 
132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000438805  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0227  30S ribosomal protein S8  50 
 
 
131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000103227  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0229  30S ribosomal protein S8  47.69 
 
 
132 aa  125  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000764714  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3129  ribosomal protein S8  46.51 
 
 
130 aa  124  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29600  SSU ribosomal protein S8P  46.51 
 
 
132 aa  125  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0072  30S ribosomal protein S8  44.62 
 
 
132 aa  124  4.0000000000000003e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00771687  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3324  30S ribosomal protein S8  48.44 
 
 
131 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000115862  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1569  ribosomal protein S8  40.77 
 
 
132 aa  124  4.0000000000000003e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.737599  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0615  30S ribosomal protein S8  47.66 
 
 
131 aa  124  4.0000000000000003e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0938448  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0124  30S ribosomal protein S8  47.69 
 
 
132 aa  124  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000599604  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0124  30S ribosomal protein S8  47.69 
 
 
132 aa  124  5e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000492709  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0120  30S ribosomal protein S8  47.69 
 
 
132 aa  124  5e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.00907e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0118  30S ribosomal protein S8  47.69 
 
 
132 aa  124  5e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509251  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23330  SSU ribosomal protein S8P  46.92 
 
 
132 aa  124  5e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000176447  hitchhiker  0.000000137084 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0136  30S ribosomal protein S8  47.69 
 
 
132 aa  124  5e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.126e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0124  30S ribosomal protein S8  47.69 
 
 
132 aa  124  5e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000367768  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2219  30S ribosomal protein S8  44.62 
 
 
133 aa  124  5e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.969535  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0145  30S ribosomal protein S8  47.69 
 
 
132 aa  124  5e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000739316  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5181  30S ribosomal protein S8  47.69 
 
 
132 aa  124  5e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000454317  unclonable  1.4651299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0155  30S ribosomal protein S8  47.69 
 
 
132 aa  124  5e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000000616269  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1469  30S ribosomal protein S8  50.77 
 
 
132 aa  124  6e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000125434  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0118  30S ribosomal protein S8  47.69 
 
 
132 aa  123  7e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000179838  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1510  ribosomal protein S8  47.69 
 
 
134 aa  123  7e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.401558  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5138  ribosomal protein S8  46.56 
 
 
132 aa  123  7e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.632245 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0239  ribosomal protein S8  43.94 
 
 
131 aa  123  9e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.363753  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0419  30S ribosomal protein S8  47.66 
 
 
130 aa  122  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000465732  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0309  ribosomal protein S8  46.09 
 
 
131 aa  123  1e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000138309  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2446  30S ribosomal protein S8  45.38 
 
 
130 aa  122  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.621263 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3981  ribosomal protein S8  48.84 
 
 
131 aa  122  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2917  30S ribosomal protein S8  49.23 
 
 
132 aa  122  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0246807  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2263  30S ribosomal protein S8  46.15 
 
 
132 aa  122  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00271668  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0208  SSU ribosomal protein S8P  40 
 
 
132 aa  122  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0121954  normal  0.508174 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0121  30S ribosomal protein S8  46.15 
 
 
132 aa  122  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0967  30S ribosomal protein S8  49.26 
 
 
134 aa  122  2e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0820886  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3991  ribosomal protein S8  43.85 
 
 
132 aa  122  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.246659  normal  0.8759 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0772  30S ribosomal protein S8  48.06 
 
 
131 aa  122  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000396885  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2304  30S ribosomal protein S8  46.15 
 
 
132 aa  122  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00657198  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0209  30S ribosomal protein S8  49.23 
 
 
132 aa  122  2e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2962  30S ribosomal protein S8  46.51 
 
 
132 aa  122  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00876753  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1124  30S ribosomal protein S8  47.06 
 
 
134 aa  122  2e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.176656  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0407  ribosomal protein S8  46.09 
 
 
130 aa  121  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000058536  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3695  30S ribosomal protein S8  46.09 
 
 
130 aa  121  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.068441  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1817  30S ribosomal protein S8  46.15 
 
 
132 aa  121  3e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4629  30S ribosomal protein S8  46.09 
 
 
130 aa  121  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000277802  normal  0.781469 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03108  hypothetical protein  46.09 
 
 
130 aa  121  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000188552  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3601  30S ribosomal protein S8  46.09 
 
 
130 aa  121  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000126765  normal  0.0104758 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2674  30S ribosomal protein S8  46.51 
 
 
132 aa  121  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0407  30S ribosomal protein S8  46.09 
 
 
130 aa  121  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000202289  hitchhiker  0.00000218378 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3622  30S ribosomal protein S8  46.09 
 
 
130 aa  121  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0133012  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5056  ribosomal protein S8  46.88 
 
 
131 aa  121  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00882416  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3789  30S ribosomal protein S8  46.09 
 
 
130 aa  121  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000933012  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3793  30S ribosomal protein S8  46.09 
 
 
130 aa  121  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.114774  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0608  SSU ribosomal protein S8P  48.06 
 
 
133 aa  121  3e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.010695  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1271  ribosomal protein S8  48.87 
 
 
131 aa  121  3e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3691  30S ribosomal protein S8  46.09 
 
 
130 aa  121  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000772145  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>