34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0495 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0495  30S ribosomal protein S28e  100 
 
 		 77 aa  149  2e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0587  30S ribosomal protein S28e  70.13 
 
 		 77 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000175398 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2275  30S ribosomal protein S28E  68.83 
 
 		 77 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1209  Ribosomal protein S28e  83.08 
 
 		 83 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.608445  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1578  30S ribosomal protein S28e  67.53 
 
 		 77 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1757  30S ribosomal protein S28e  66.23 
 
 		 77 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0124753  hitchhiker  0.00253054 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0027  30S ribosomal protein S28e  78.46 
 
 		 80 aa  107  5e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00920354 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1237  Ribosomal protein S28e  80.6 
 
 		 69 aa  107  6e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1847  30S ribosomal protein S28e  73.53 
 
 		 80 aa  102  2e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1554  30S ribosomal protein S28e  63.24 
 
 		 76 aa  97.8  5e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0964  30S ribosomal protein S28e  63.24 
 
 		 76 aa  97.4  6e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1664  30S ribosomal protein S28e  63.24 
 
 		 76 aa  96.7  8e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.024541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0249  30S ribosomal protein S28e  63.24 
 
 		 76 aa  96.7  8e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.166189  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0226  30S ribosomal protein S28e  71.43 
 
 		 70 aa  95.5  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0080  30S ribosomal protein S28e  60.29 
 
 		 75 aa  95.5  2e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.264632  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3387  30S ribosomal protein S28e  58.57 
 
 		 73 aa  90.1  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.0000000000025371  normal  0.0615713 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0332  30S ribosomal protein S28e  60.61 
 
 		 70 aa  89.4  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1498  30S ribosomal protein S28e  60.61 
 
 		 69 aa  89.4  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.174121 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0220  30S ribosomal protein S28e  61.54 
 
 		 71 aa  89  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000043121  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0689  30S ribosomal protein S28e  57.58 
 
 		 69 aa  87.4  5e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.256575 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1602  30S ribosomal protein S28e  57.58 
 
 		 67 aa  84.3  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.706579 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0524  30S ribosomal protein S28e  57.58 
 
 		 69 aa  84.7  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.529913 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0720  30S ribosomal protein S28e  59.7 
 
 		 69 aa  84.3  5e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0378915  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2622  Ribosomal protein S28e  53.33 
 
 		 75 aa  82  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.242358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0452  Ribosomal protein S28e  52.94 
 
 		 74 aa  80.1  0.000000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.300197  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1843  30S ribosomal protein S28e  53.03 
 
 		 74 aa  79.7  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00486398  normal  0.189699 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0751  30S ribosomal protein S28e  53.33 
 
 		 75 aa  79  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2526  Ribosomal protein S28e  51.47 
 
 		 74 aa  79  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_23748  predicted protein  55.93 
 
 		 67 aa  65.5  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0475517  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119484  Ribosomal protein S28e  57.63 
 
 		 64 aa  63.9  0.0000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0214656  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59713  predicted protein  55.93 
 
 		 67 aa  62.4  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0328112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87256  predicted protein  55.93 
 
 		 67 aa  62.4  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06632  Ribosomal protein S28e (AFU_orthologue; AFUA_7G04490)  53.45 
 
 		 68 aa  58.2  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.135585 
 
 
-
 
NC_006686  CND06280  conserved hypothetical protein  55.56 
 
 		 61 aa  56.6  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0919907  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>