34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3387 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3387  30S ribosomal protein S28e  100 
 
 		 73 aa  147  3e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.0000000000025371  normal  0.0615713 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0220  30S ribosomal protein S28e  86.3 
 
 		 71 aa  131  3e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000043121  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0332  30S ribosomal protein S28e  73.97 
 
 		 70 aa  110  6e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0524  30S ribosomal protein S28e  69.86 
 
 		 69 aa  102  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.529913 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1498  30S ribosomal protein S28e  76.19 
 
 		 69 aa  99.8  1e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.174121 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1602  30S ribosomal protein S28e  69.23 
 
 		 67 aa  97.4  6e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.706579 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0689  30S ribosomal protein S28e  63.01 
 
 		 69 aa  97.4  6e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.256575 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0720  30S ribosomal protein S28e  70.77 
 
 		 69 aa  97.1  7e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0378915  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1237  Ribosomal protein S28e  63.01 
 
 		 69 aa  94.4  5e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2526  Ribosomal protein S28e  59.42 
 
 		 74 aa  92.8  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1209  Ribosomal protein S28e  64.62 
 
 		 83 aa  91.7  3e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.608445  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0452  Ribosomal protein S28e  57.97 
 
 		 74 aa  91.7  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.300197  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0495  30S ribosomal protein S28e  58.57 
 
 		 77 aa  90.1  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0027  30S ribosomal protein S28e  63.08 
 
 		 80 aa  89.4  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00920354 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2622  Ribosomal protein S28e  59.38 
 
 		 75 aa  85.5  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.242358  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1843  30S ribosomal protein S28e  54.17 
 
 		 74 aa  84.3  6e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00486398  normal  0.189699 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0587  30S ribosomal protein S28e  58.73 
 
 		 77 aa  83.6  9e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000175398 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2275  30S ribosomal protein S28E  60.32 
 
 		 77 aa  83.2  0.000000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1847  30S ribosomal protein S28e  61.9 
 
 		 80 aa  83.2  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1578  30S ribosomal protein S28e  58.73 
 
 		 77 aa  81.6  0.000000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1757  30S ribosomal protein S28e  58.33 
 
 		 77 aa  80.9  0.000000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0124753  hitchhiker  0.00253054 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0751  30S ribosomal protein S28e  60.32 
 
 		 75 aa  80.9  0.000000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1554  30S ribosomal protein S28e  54.05 
 
 		 76 aa  79.3  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0080  30S ribosomal protein S28e  52.7 
 
 		 75 aa  77.8  0.00000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.264632  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0964  30S ribosomal protein S28e  51.35 
 
 		 76 aa  77  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0249  30S ribosomal protein S28e  51.35 
 
 		 76 aa  76.6  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.166189  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1664  30S ribosomal protein S28e  51.35 
 
 		 76 aa  76.6  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.024541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0226  30S ribosomal protein S28e  55.93 
 
 		 70 aa  73.9  0.0000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119484  Ribosomal protein S28e  49.15 
 
 		 64 aa  57  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0214656  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59713  predicted protein  49.15 
 
 		 67 aa  54.7  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0328112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87256  predicted protein  49.15 
 
 		 67 aa  54.3  0.0000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_23748  predicted protein  47.46 
 
 		 67 aa  53.9  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0475517  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06632  Ribosomal protein S28e (AFU_orthologue; AFUA_7G04490)  42.65 
 
 		 68 aa  51.2  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.135585 
 
 
-
 
NC_006686  CND06280  conserved hypothetical protein  48.15 
 
 		 61 aa  50.4  0.000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0919907  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>