More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2966 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2966  amidohydrolase  100 
 
 		 443 aa  884    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5279  amidohydrolase  59.76 
 
 		 447 aa  474  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4377  guanine deaminase  53.17 
 
 		 469 aa  438  9.999999999999999e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4281  guanine deaminase  39.47 
 
 		 434 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3845  guanine deaminase  39.47 
 
 		 434 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397164 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1587  guanine deaminase  39.47 
 
 		 434 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22260  guanine deaminase  40.29 
 
 		 432 aa  239  6.999999999999999e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.119985  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1794  guanine deaminase  38.41 
 
 		 434 aa  239  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.868706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3607  guanine deaminase  39.02 
 
 		 434 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0256  guanine deaminase  40.14 
 
 		 439 aa  232  8.000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2299  guanine deaminase  36.67 
 
 		 443 aa  232  9e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1677  guanine deaminase  36.45 
 
 		 433 aa  232  1e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02716  guanine deaminase  35.41 
 
 		 439 aa  229  5e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712282  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02678  hypothetical protein  35.41 
 
 		 439 aa  229  5e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.600174  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44770  guanine deaminase  38.63 
 
 		 434 aa  229  6e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.828703  normal  0.188746 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01787  hypothetical protein  35.73 
 
 		 466 aa  229  1e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2754  guanine deaminase  36.69 
 
 		 433 aa  228  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.481519 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0825  guanine deaminase  34.6 
 
 		 438 aa  227  2e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3209  guanine deaminase  34.6 
 
 		 438 aa  227  2e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0809  guanine deaminase  34.6 
 
 		 438 aa  227  3e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3043  guanine deaminase  34.74 
 
 		 438 aa  227  3e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4173  guanine deaminase  34.6 
 
 		 438 aa  227  3e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3016  guanine deaminase  34.61 
 
 		 438 aa  226  4e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2606  guanine deaminase  40.14 
 
 		 444 aa  225  1e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3812  guanine deaminase  38.19 
 
 		 434 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.203808  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1148  amidohydrolase  39.39 
 
 		 486 aa  223  4e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.318929  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1812  guanine deaminase  36.08 
 
 		 444 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00974317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3717  guanine deaminase  37.73 
 
 		 429 aa  218  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3663  guanine aminohydrolase  36.18 
 
 		 437 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0081  amidohydrolase  36.04 
 
 		 513 aa  218  1e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4872  guanine deaminase  35.7 
 
 		 449 aa  216  5e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.673098  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1336  guanine deaminase  39.37 
 
 		 435 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.521939  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2684  guanine deaminase  32.15 
 
 		 441 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.573349 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01660  guanine deaminase  39.6 
 
 		 456 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000118805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0210  guanine deaminase  39.4 
 
 		 432 aa  211  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.20137  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1795  guanine deaminase  36.65 
 
 		 432 aa  208  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.319049  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3142  guanine deaminase  33.93 
 
 		 436 aa  207  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.14624  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1807  guanine deaminase  36.14 
 
 		 446 aa  207  4e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000553099  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3192  guanine deaminase  37.7 
 
 		 449 aa  206  6e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.673626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3326  guanine deaminase  34.45 
 
 		 435 aa  201  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0946  guanine deaminase  32.96 
 
 		 451 aa  196  7e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334638  normal  0.424226 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2870  guanine deaminase  33.18 
 
 		 435 aa  193  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.153116 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1143  guanine deaminase  33.57 
 
 		 428 aa  192  7e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.14597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2838  guanine deaminase  33.18 
 
 		 434 aa  192  7e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.444806  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4494  guanine deaminase  34.36 
 
 		 435 aa  192  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0638874  normal  0.0636141 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4655  guanine deaminase  37.29 
 
 		 457 aa  192  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0274988  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2429  guanine deaminase  32.94 
 
 		 431 aa  191  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3045  guanine deaminase  32.43 
 
 		 457 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.206823  normal  0.141945 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0893  guanine deaminase  33.89 
 
 		 438 aa  190  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0756096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4260  guanine deaminase  33.41 
 
 		 425 aa  190  4e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.910106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4129  guanine deaminase  32.66 
 
 		 438 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1087  guanine deaminase  35.71 
 
 		 457 aa  188  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0146521 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0545  guanine deaminase  35.96 
 
 		 428 aa  188  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2377  guanine deaminase  33.26 
 
 		 439 aa  188  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.796063  normal  0.732304 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1727  guanine deaminase  35.71 
 
 		 452 aa  187  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.434119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0539  guanine deaminase  32.96 
 
 		 439 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1018  guanine deaminase  32.96 
 
 		 439 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0977  guanine deaminase  32.73 
 
 		 439 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0414452 
 
 
-
 
NC_004310  BR0354  guanine deaminase  33.25 
 
 		 434 aa  187  4e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0370  guanine deaminase  33.25 
 
 		 434 aa  187  5e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.230205  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2046  guanine deaminase  35.48 
 
 		 452 aa  186  8e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177828  normal  0.651599 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1896  guanine deaminase  35.43 
 
 		 433 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0881  guanine deaminase  33.89 
 
 		 438 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.821524  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0506  guanine deaminase  31.45 
 
 		 465 aa  182  8.000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0456  guanine deaminase  32.78 
 
 		 434 aa  182  9.000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0293  guanine deaminase  34.99 
 
 		 426 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2724  guanine deaminase  32.77 
 
 		 425 aa  181  2.9999999999999997e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0889  guanine deaminase  32.61 
 
 		 446 aa  180  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.159977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4625  guanine deaminase  31.99 
 
 		 447 aa  180  5.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.430513 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1462  guanine deaminase  37.65 
 
 		 430 aa  179  8e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0429597  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3023  guanine deaminase  35.45 
 
 		 436 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0166  guanine deaminase  34.89 
 
 		 436 aa  178  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.301231  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0463  guanine deaminase  34.89 
 
 		 436 aa  178  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.451458  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2429  guanine deaminase  33.26 
 
 		 440 aa  178  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.935428  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2918  guanine deaminase  34.89 
 
 		 436 aa  178  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.495945  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2609  guanine deaminase  34.89 
 
 		 436 aa  178  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.694405  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1610  guanine deaminase  35.29 
 
 		 437 aa  177  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0981  guanine deaminase  34.89 
 
 		 436 aa  178  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2978  guanine deaminase  34.89 
 
 		 436 aa  178  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.528772  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3458  guanine deaminase  36.29 
 
 		 434 aa  176  8e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.164027 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1905  guanine deaminase  32.39 
 
 		 429 aa  176  9e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1468  guanine deaminase  30.21 
 
 		 405 aa  176  9.999999999999999e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00567224  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3479  guanine deaminase  30.63 
 
 		 461 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1926  guanine deaminase  32.61 
 
 		 444 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0907648  normal  0.0757179 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0709  guanine deaminase  33.76 
 
 		 441 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2250  guanine deaminase  32.61 
 
 		 444 aa  172  7.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2099  guanine deaminase  33.76 
 
 		 445 aa  172  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.716358 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2623  guanine deaminase  35.85 
 
 		 454 aa  172  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0801  guanine deaminase  34.42 
 
 		 445 aa  170  6e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1786  guanine deaminase  34.86 
 
 		 453 aa  169  7e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2771  guanine deaminase  33.18 
 
 		 428 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.888774  normal  0.860518 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1496  guanine deaminase  33.25 
 
 		 449 aa  166  6.9999999999999995e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02520  guanine deaminase  33.33 
 
 		 435 aa  166  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3881  guanine deaminase  33.66 
 
 		 428 aa  163  6e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1049  guanine deaminase  33.85 
 
 		 427 aa  161  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3295  guanine deaminase  33.5 
 
 		 445 aa  160  4e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.403629  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1129  guanine deaminase  34.37 
 
 		 427 aa  160  4e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.387393  normal  0.517294 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5972  guanine deaminase  36.94 
 
 		 419 aa  160  6e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.747945 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1047  guanine deaminase  32.55 
 
 		 430 aa  158  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.134811  normal  0.230797 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1336  guanine deaminase  32.69 
 
 		 432 aa  157  5.0000000000000005e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.117257  hitchhiker  0.000886879 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>