28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2899 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2899  amino acid-binding ACT domain protein  100 
 
 		 217 aa  420  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3245  amino acid-binding ACT domain protein  67.44 
 
 		 221 aa  281  5.000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.163508  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2113  amino acid-binding ACT domain-containing protein  65.28 
 
 		 222 aa  262  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.2373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4247  amino acid-binding ACT domain-containing protein  64.35 
 
 		 222 aa  259  3e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.100152  normal  0.817621 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13028  hypothetical protein  63.89 
 
 		 240 aa  259  3e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0105664  normal  0.507184 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1889  amino acid-binding ACT  63.43 
 
 		 222 aa  251  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0231106  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1935  amino acid-binding ACT domain-containing protein  63.43 
 
 		 222 aa  251  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.845407 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1869  amino acid-binding ACT domain-containing protein  63.43 
 
 		 222 aa  251  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.089814 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08720  ACT domain-containing protein  53.18 
 
 		 222 aa  216  2.9999999999999998e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6036  amino acid-binding ACT domain protein  53.21 
 
 		 215 aa  211  9e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1459  amino acid-binding ACT domain protein  47.25 
 
 		 228 aa  181  9.000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.583001  normal  0.306182 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4085  amino acid-binding ACT domain protein  45.45 
 
 		 226 aa  179  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3646  amino acid-binding ACT  41.15 
 
 		 236 aa  131  9e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0254  amino acid-binding ACT domain-containing protein  32.09 
 
 		 207 aa  102  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1875  amino acid-binding ACT domain protein  35.19 
 
 		 234 aa  93.2  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.656934  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1888  amino acid-binding ACT domain-containing protein  31.75 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.229412 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3349  hypothetical protein  31.51 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0029421 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1531  amino acid-binding ACT domain-containing protein  29.72 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4565  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  31.25 
 
 		 476 aa  52.4  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.423371  normal  0.479967 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1947  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  39.19 
 
 		 470 aa  48.9  0.00006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2866  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  31.01 
 
 		 489 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0212  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  32.03 
 
 		 500 aa  47  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.455099  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3355  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  33.33 
 
 		 492 aa  45.8  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240183 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1448  malate dehydrogenase  27.2 
 
 		 513 aa  43.9  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.320703  normal  0.623093 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2308  malate oxidoreductase  30.99 
 
 		 446 aa  43.5  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1406  malate dehydrogenase  26.4 
 
 		 490 aa  42.7  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000179901 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2232  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  22.48 
 
 		 478 aa  42.7  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2490  malate dehydrogenase  24.8 
 
 		 473 aa  42.4  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.148029  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>