31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6036 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6036  amino acid-binding ACT domain protein  100 
 
 		 215 aa  407  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08720  ACT domain-containing protein  72.4 
 
 		 222 aa  295  4e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2113  amino acid-binding ACT domain-containing protein  54.63 
 
 		 222 aa  223  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.2373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4247  amino acid-binding ACT domain-containing protein  53.7 
 
 		 222 aa  223  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.100152  normal  0.817621 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1889  amino acid-binding ACT  55.09 
 
 		 222 aa  222  3e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0231106  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1935  amino acid-binding ACT domain-containing protein  55.09 
 
 		 222 aa  222  3e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.845407 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1869  amino acid-binding ACT domain-containing protein  55.09 
 
 		 222 aa  222  3e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.089814 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3245  amino acid-binding ACT domain protein  53.02 
 
 		 221 aa  218  7.999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.163508  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1459  amino acid-binding ACT domain protein  53.21 
 
 		 228 aa  217  1e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.583001  normal  0.306182 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2899  amino acid-binding ACT domain protein  53.21 
 
 		 217 aa  211  9e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4085  amino acid-binding ACT domain protein  51.36 
 
 		 226 aa  207  7e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13028  hypothetical protein  51.39 
 
 		 240 aa  206  2e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0105664  normal  0.507184 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3646  amino acid-binding ACT  46.7 
 
 		 236 aa  159  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0254  amino acid-binding ACT domain-containing protein  37.14 
 
 		 207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1875  amino acid-binding ACT domain protein  37.56 
 
 		 234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.656934  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1888  amino acid-binding ACT domain-containing protein  33.02 
 
 		 206 aa  92.8  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.229412 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3349  hypothetical protein  32.86 
 
 		 210 aa  93.2  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0029421 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1531  amino acid-binding ACT domain-containing protein  28.84 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2866  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  30.17 
 
 		 489 aa  49.3  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2458  amino acid-binding ACT  23.73 
 
 		 463 aa  47.8  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08210  malic enzyme  27.83 
 
 		 474 aa  47.4  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1947  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  39.44 
 
 		 470 aa  46.2  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3355  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  27.35 
 
 		 492 aa  46.6  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240183 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1195  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  25.22 
 
 		 463 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.232421 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2232  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  25 
 
 		 478 aa  45.4  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2286  malate dehydrogenase  25.22 
 
 		 474 aa  45.1  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1656  malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  25.42 
 
 		 463 aa  44.7  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.965749  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0554  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  26.72 
 
 		 463 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.468225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2490  malate dehydrogenase  26.09 
 
 		 473 aa  44.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.148029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1406  malate dehydrogenase  25 
 
 		 490 aa  42.7  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000179901 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1376  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  24.14 
 
 		 478 aa  42.4  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000390692  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>