22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1889 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1889  amino acid-binding ACT  100 
 
 		 222 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0231106  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1935  amino acid-binding ACT domain-containing protein  100 
 
 		 222 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.845407 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1869  amino acid-binding ACT domain-containing protein  100 
 
 		 222 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.089814 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2113  amino acid-binding ACT domain-containing protein  82.81 
 
 		 222 aa  362  3e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.2373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4247  amino acid-binding ACT domain-containing protein  81.9 
 
 		 222 aa  355  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.100152  normal  0.817621 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13028  hypothetical protein  74.77 
 
 		 240 aa  325  5e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0105664  normal  0.507184 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3245  amino acid-binding ACT domain protein  63.59 
 
 		 221 aa  266  2e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.163508  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2899  amino acid-binding ACT domain protein  63.43 
 
 		 217 aa  258  7e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08720  ACT domain-containing protein  55.41 
 
 		 222 aa  231  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6036  amino acid-binding ACT domain protein  55.09 
 
 		 215 aa  227  9e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4085  amino acid-binding ACT domain protein  49.32 
 
 		 226 aa  201  9e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1459  amino acid-binding ACT domain protein  50.23 
 
 		 228 aa  197  9e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.583001  normal  0.306182 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3646  amino acid-binding ACT  40.51 
 
 		 236 aa  129  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0254  amino acid-binding ACT domain-containing protein  34.86 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1875  amino acid-binding ACT domain protein  33.03 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.656934  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3349  hypothetical protein  32.24 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0029421 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1888  amino acid-binding ACT domain-containing protein  33.49 
 
 		 206 aa  78.2  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.229412 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1531  amino acid-binding ACT domain-containing protein  32.11 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3355  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  33.82 
 
 		 492 aa  46.2  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240183 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1947  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  33.71 
 
 		 470 aa  45.8  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2490  malate dehydrogenase  30.99 
 
 		 473 aa  43.9  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.148029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2286  malate dehydrogenase  29.58 
 
 		 474 aa  43.9  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>