32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1459 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1459  amino acid-binding ACT domain protein  100 
 
 		 228 aa  433  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.583001  normal  0.306182 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6036  amino acid-binding ACT domain protein  53.21 
 
 		 215 aa  217  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08720  ACT domain-containing protein  52.97 
 
 		 222 aa  216  2.9999999999999998e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4247  amino acid-binding ACT domain-containing protein  52.49 
 
 		 222 aa  206  3e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.100152  normal  0.817621 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2113  amino acid-binding ACT domain-containing protein  49.77 
 
 		 222 aa  198  6e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.2373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4085  amino acid-binding ACT domain protein  49.12 
 
 		 226 aa  193  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1889  amino acid-binding ACT  49.32 
 
 		 222 aa  191  6e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0231106  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1935  amino acid-binding ACT domain-containing protein  49.32 
 
 		 222 aa  191  6e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.845407 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1869  amino acid-binding ACT domain-containing protein  49.32 
 
 		 222 aa  191  6e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.089814 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13028  hypothetical protein  49.32 
 
 		 240 aa  189  4e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0105664  normal  0.507184 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3245  amino acid-binding ACT domain protein  48.17 
 
 		 221 aa  186  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.163508  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2899  amino acid-binding ACT domain protein  47.25 
 
 		 217 aa  181  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3646  amino acid-binding ACT  42.55 
 
 		 236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0254  amino acid-binding ACT domain-containing protein  36.53 
 
 		 207 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1888  amino acid-binding ACT domain-containing protein  33.18 
 
 		 206 aa  88.6  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.229412 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1875  amino acid-binding ACT domain protein  32.88 
 
 		 234 aa  85.1  9e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.656934  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3349  hypothetical protein  39.84 
 
 		 210 aa  81.3  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0029421 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1531  amino acid-binding ACT domain-containing protein  29.72 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1947  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  45.95 
 
 		 470 aa  56.6  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3355  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  33.33 
 
 		 492 aa  48.9  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240183 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2866  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  40.28 
 
 		 489 aa  46.6  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2141  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  26.39 
 
 		 474 aa  44.7  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2286  malate dehydrogenase  32.43 
 
 		 474 aa  43.9  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08210  malic enzyme  31.08 
 
 		 474 aa  43.9  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2232  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  30.67 
 
 		 478 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2490  malate dehydrogenase  33.33 
 
 		 473 aa  43.5  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.148029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0554  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  30.67 
 
 		 463 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.468225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1299  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  32.84 
 
 		 746 aa  42  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.202283  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2550  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  32.84 
 
 		 746 aa  42  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1376  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  26 
 
 		 478 aa  42  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000390692  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1400  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  32.84 
 
 		 746 aa  42  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.112475  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1195  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  30.56 
 
 		 463 aa  41.6  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.232421 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>