31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4085 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4085  amino acid-binding ACT domain protein  100 
 
 		 226 aa  433  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08720  ACT domain-containing protein  51.79 
 
 		 222 aa  221  7e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6036  amino acid-binding ACT domain protein  51.36 
 
 		 215 aa  207  8e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1869  amino acid-binding ACT domain-containing protein  49.32 
 
 		 222 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.089814 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1935  amino acid-binding ACT domain-containing protein  49.32 
 
 		 222 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.845407 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1889  amino acid-binding ACT  49.32 
 
 		 222 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0231106  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4247  amino acid-binding ACT domain-containing protein  47.95 
 
 		 222 aa  195  6e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.100152  normal  0.817621 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3245  amino acid-binding ACT domain protein  48.64 
 
 		 221 aa  194  7e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.163508  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13028  hypothetical protein  49.77 
 
 		 240 aa  194  8.000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0105664  normal  0.507184 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2113  amino acid-binding ACT domain-containing protein  48.4 
 
 		 222 aa  194  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.2373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1459  amino acid-binding ACT domain protein  49.12 
 
 		 228 aa  193  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.583001  normal  0.306182 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2899  amino acid-binding ACT domain protein  45.45 
 
 		 217 aa  179  2.9999999999999997e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3646  amino acid-binding ACT  47.62 
 
 		 236 aa  162  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0254  amino acid-binding ACT domain-containing protein  38.57 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1875  amino acid-binding ACT domain protein  34.68 
 
 		 234 aa  92.4  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.656934  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1888  amino acid-binding ACT domain-containing protein  33.03 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.229412 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3349  hypothetical protein  31.48 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0029421 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1531  amino acid-binding ACT domain-containing protein  30.91 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2286  malate dehydrogenase  25.58 
 
 		 474 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1947  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  32.54 
 
 		 470 aa  47.4  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1656  malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  24.85 
 
 		 463 aa  47  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.965749  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2458  amino acid-binding ACT  26.13 
 
 		 463 aa  47.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2866  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  33.94 
 
 		 489 aa  46.6  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3355  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  25.58 
 
 		 492 aa  45.8  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240183 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2232  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  28.12 
 
 		 478 aa  45.1  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2490  malate dehydrogenase  25.58 
 
 		 473 aa  43.5  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.148029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1333  prephenate dehydrogenase  50 
 
 		 375 aa  43.5  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000339582  normal  0.134491 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1195  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  25.42 
 
 		 463 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.232421 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2550  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  31.34 
 
 		 746 aa  41.6  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1400  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  31.34 
 
 		 746 aa  41.6  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.112475  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1299  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  31.34 
 
 		 746 aa  41.6  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.202283  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>