29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0254 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0254  amino acid-binding ACT domain-containing protein  100 
 
 		 207 aa  409  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6036  amino acid-binding ACT domain protein  37.14 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4247  amino acid-binding ACT domain-containing protein  37.67 
 
 		 222 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.100152  normal  0.817621 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08720  ACT domain-containing protein  36.11 
 
 		 222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13028  hypothetical protein  35.65 
 
 		 240 aa  112  3e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0105664  normal  0.507184 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3245  amino acid-binding ACT domain protein  36.11 
 
 		 221 aa  111  8.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.163508  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1459  amino acid-binding ACT domain protein  36.53 
 
 		 228 aa  111  9e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.583001  normal  0.306182 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2113  amino acid-binding ACT domain-containing protein  36.74 
 
 		 222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.2373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4085  amino acid-binding ACT domain protein  38.57 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3646  amino acid-binding ACT  36.64 
 
 		 236 aa  102  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2899  amino acid-binding ACT domain protein  32.09 
 
 		 217 aa  102  6e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1889  amino acid-binding ACT  34.4 
 
 		 222 aa  98.6  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0231106  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1935  amino acid-binding ACT domain-containing protein  34.4 
 
 		 222 aa  98.6  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.845407 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1869  amino acid-binding ACT domain-containing protein  34.4 
 
 		 222 aa  98.6  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.089814 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1888  amino acid-binding ACT domain-containing protein  31.94 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.229412 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1531  amino acid-binding ACT domain-containing protein  31 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1875  amino acid-binding ACT domain protein  29.9 
 
 		 234 aa  72  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.656934  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3349  hypothetical protein  34.51 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0029421 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2866  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  44.29 
 
 		 489 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3355  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  38.89 
 
 		 492 aa  48.9  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240183 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1947  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  52 
 
 		 470 aa  48.1  0.00008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2490  malate dehydrogenase  40.54 
 
 		 473 aa  47  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.148029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2286  malate dehydrogenase  39.19 
 
 		 474 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1269  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.03 
 
 		 529 aa  45.4  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0254425 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0212  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  41.54 
 
 		 500 aa  45.1  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.455099  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1406  malate dehydrogenase  34.72 
 
 		 490 aa  43.5  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000179901 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2125  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  30 
 
 		 531 aa  42.4  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000018587  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1760  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.62 
 
 		 531 aa  42  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1110  malate dehydrogenase  41.1 
 
 		 481 aa  41.6  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.421684  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>