18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0962 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0962  response regulator receiver  100 
 
 		 169 aa  317  3.9999999999999996e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0882879  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0042  hypothetical protein  47.96 
 
 		 188 aa  143  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.53163 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4940  hypothetical protein  46.49 
 
 		 178 aa  134  7.000000000000001e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3129  hypothetical protein  54.49 
 
 		 179 aa  131  3.9999999999999996e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5833  hypothetical protein  42.31 
 
 		 178 aa  110  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2434  hypothetical protein  49.18 
 
 		 183 aa  108  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.13774  normal  0.165313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7592  hypothetical protein  43.79 
 
 		 176 aa  107  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.136028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2083  response regulator receiver  49.43 
 
 		 167 aa  105  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.271668  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1186  hypothetical protein  47.59 
 
 		 175 aa  100  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.785944  hitchhiker  0.000092673 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4275  hypothetical protein  44 
 
 		 168 aa  89  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4137  hypothetical protein  46.28 
 
 		 201 aa  87  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.969888  normal  0.385246 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4408  hypothetical protein  44.64 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0233078  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5812  HicB family protein  38 
 
 		 185 aa  70.5  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0338  CopG family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 167 aa  69.3  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.190218  hitchhiker  0.000976234 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1717  hypothetical protein  34.84 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.112681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0284  hypothetical protein  53.12 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25290  HicB family protein  35.9 
 
 		 173 aa  57  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0558474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2234  hypothetical protein  34.5 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000124659  normal  0.392099 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>