18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0042 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0042  hypothetical protein  100 
 
 
188 aa  357  5e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.53163 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4940  hypothetical protein  55.98 
 
 
178 aa  168  4e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2434  hypothetical protein  61.7 
 
 
183 aa  150  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.13774  normal  0.165313 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0962  response regulator receiver  47.96 
 
 
169 aa  143  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0882879  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3129  hypothetical protein  48.42 
 
 
179 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1186  hypothetical protein  53.69 
 
 
175 aa  132  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.785944  hitchhiker  0.000092673 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2083  response regulator receiver  50.79 
 
 
167 aa  129  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.271668  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7592  hypothetical protein  45.74 
 
 
176 aa  126  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.136028  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4137  hypothetical protein  53.03 
 
 
201 aa  122  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.969888  normal  0.385246 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5833  hypothetical protein  41.54 
 
 
178 aa  120  8e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4275  hypothetical protein  38.74 
 
 
168 aa  93.2  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1717  hypothetical protein  35.05 
 
 
186 aa  79.3  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.112681  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4408  hypothetical protein  34.91 
 
 
164 aa  77.4  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0233078  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5812  HicB family protein  35.58 
 
 
185 aa  74.7  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2234  hypothetical protein  31.25 
 
 
189 aa  69.7  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000124659  normal  0.392099 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0338  CopG family transcriptional regulator  39.76 
 
 
167 aa  69.3  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.190218  hitchhiker  0.000976234 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25290  HicB family protein  32.65 
 
 
173 aa  65.5  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0558474  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0284  hypothetical protein  49.23 
 
 
65 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>