17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_25290 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_25290  HicB family protein  100 
 
 		 173 aa  342  1e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0558474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5812  HicB family protein  52.94 
 
 		 185 aa  167  5e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2234  hypothetical protein  45.36 
 
 		 189 aa  127  6e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000124659  normal  0.392099 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0042  hypothetical protein  37.31 
 
 		 188 aa  94.7  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.53163 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4940  hypothetical protein  37.5 
 
 		 178 aa  87  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4275  hypothetical protein  38.55 
 
 		 168 aa  82.4  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4408  hypothetical protein  39.74 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0233078  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0962  response regulator receiver  34.44 
 
 		 169 aa  81.3  0.000000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0882879  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1717  hypothetical protein  34.54 
 
 		 186 aa  75.1  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.112681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3129  hypothetical protein  38.07 
 
 		 179 aa  74.3  0.0000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5833  hypothetical protein  33.15 
 
 		 178 aa  70.1  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4137  hypothetical protein  38.92 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.969888  normal  0.385246 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2434  hypothetical protein  38.98 
 
 		 183 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.13774  normal  0.165313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7592  hypothetical protein  34.04 
 
 		 176 aa  60.8  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.136028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2083  response regulator receiver  37.79 
 
 		 167 aa  60.1  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.271668  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0338  CopG family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.190218  hitchhiker  0.000976234 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1186  hypothetical protein  40.88 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.785944  hitchhiker  0.000092673 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>